Protein–RNA interactions for Protein: A0A1B0GVQ0

SPAAR, Small regulatory polypeptide of amino acid response, humanhuman

Predictions only

Length 90 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPAARA0A1B0GVQ0 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPAARA0A1B0GVQ0 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPAARA0A1B0GVQ0 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPAARA0A1B0GVQ0 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPAARA0A1B0GVQ0 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPAARA0A1B0GVQ0 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPAARA0A1B0GVQ0 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPAARA0A1B0GVQ0 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPAARA0A1B0GVQ0 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPAARA0A1B0GVQ0 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPAARA0A1B0GVQ0 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPAARA0A1B0GVQ0 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPAARA0A1B0GVQ0 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SPAARA0A1B0GVQ0 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SPAARA0A1B0GVQ0 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SPAARA0A1B0GVQ0 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SPAARA0A1B0GVQ0 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPAARA0A1B0GVQ0 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPAARA0A1B0GVQ0 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPAARA0A1B0GVQ0 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPAARA0A1B0GVQ0 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPAARA0A1B0GVQ0 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPAARA0A1B0GVQ0 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPAARA0A1B0GVQ0 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPAARA0A1B0GVQ0 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPAARA0A1B0GVQ0 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPAARA0A1B0GVQ0 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPAARA0A1B0GVQ0 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPAARA0A1B0GVQ0 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SPAARA0A1B0GVQ0 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SPAARA0A1B0GVQ0 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SPAARA0A1B0GVQ0 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SPAARA0A1B0GVQ0 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SPAARA0A1B0GVQ0 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SPAARA0A1B0GVQ0 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SPAARA0A1B0GVQ0 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SPAARA0A1B0GVQ0 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SPAARA0A1B0GVQ0 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SPAARA0A1B0GVQ0 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPAARA0A1B0GVQ0 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPAARA0A1B0GVQ0 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPAARA0A1B0GVQ0 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPAARA0A1B0GVQ0 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SPAARA0A1B0GVQ0 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPAARA0A1B0GVQ0 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPAARA0A1B0GVQ0 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPAARA0A1B0GVQ0 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPAARA0A1B0GVQ0 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SPAARA0A1B0GVQ0 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SPAARA0A1B0GVQ0 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SPAARA0A1B0GVQ0 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SPAARA0A1B0GVQ0 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SPAARA0A1B0GVQ0 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SPAARA0A1B0GVQ0 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SPAARA0A1B0GVQ0 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SPAARA0A1B0GVQ0 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SPAARA0A1B0GVQ0 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SPAARA0A1B0GVQ0 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SPAARA0A1B0GVQ0 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SPAARA0A1B0GVQ0 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SPAARA0A1B0GVQ0 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SPAARA0A1B0GVQ0 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SPAARA0A1B0GVQ0 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SPAARA0A1B0GVQ0 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SPAARA0A1B0GVQ0 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SPAARA0A1B0GVQ0 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SPAARA0A1B0GVQ0 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SPAARA0A1B0GVQ0 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SPAARA0A1B0GVQ0 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SPAARA0A1B0GVQ0 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SPAARA0A1B0GVQ0 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SPAARA0A1B0GVQ0 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SPAARA0A1B0GVQ0 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SPAARA0A1B0GVQ0 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SPAARA0A1B0GVQ0 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SPAARA0A1B0GVQ0 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SPAARA0A1B0GVQ0 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SPAARA0A1B0GVQ0 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SPAARA0A1B0GVQ0 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SPAARA0A1B0GVQ0 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SPAARA0A1B0GVQ0 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SPAARA0A1B0GVQ0 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SPAARA0A1B0GVQ0 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SPAARA0A1B0GVQ0 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
SPAARA0A1B0GVQ0 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SPAARA0A1B0GVQ0 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SPAARA0A1B0GVQ0 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SPAARA0A1B0GVQ0 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SPAARA0A1B0GVQ0 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SPAARA0A1B0GVQ0 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
SPAARA0A1B0GVQ0 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SPAARA0A1B0GVQ0 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SPAARA0A1B0GVQ0 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SPAARA0A1B0GVQ0 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SPAARA0A1B0GVQ0 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SPAARA0A1B0GVQ0 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SPAARA0A1B0GVQ0 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SPAARA0A1B0GVQ0 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SPAARA0A1B0GVQ0 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SPAARA0A1B0GVQ0 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms