Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J269

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0B4J269 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
A0A0B4J269 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
A0A0B4J269 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
A0A0B4J269 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
A0A0B4J269 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
A0A0B4J269 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
A0A0B4J269 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
A0A0B4J269 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
A0A0B4J269 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
A0A0B4J269 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
A0A0B4J269 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
A0A0B4J269 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
A0A0B4J269 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
A0A0B4J269 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
A0A0B4J269 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
A0A0B4J269 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
A0A0B4J269 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
A0A0B4J269 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
A0A0B4J269 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
A0A0B4J269 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
A0A0B4J269 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
A0A0B4J269 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
A0A0B4J269 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
A0A0B4J269 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
A0A0B4J269 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
A0A0B4J269 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
A0A0B4J269 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
A0A0B4J269 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
A0A0B4J269 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
A0A0B4J269 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
A0A0B4J269 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
A0A0B4J269 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
A0A0B4J269 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
A0A0B4J269 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
A0A0B4J269 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
A0A0B4J269 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
A0A0B4J269 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
A0A0B4J269 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
A0A0B4J269 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
A0A0B4J269 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
A0A0B4J269 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
A0A0B4J269 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
A0A0B4J269 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
A0A0B4J269 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
A0A0B4J269 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
A0A0B4J269 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
A0A0B4J269 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
A0A0B4J269 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
A0A0B4J269 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
A0A0B4J269 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
A0A0B4J269 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
A0A0B4J269 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
A0A0B4J269 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
A0A0B4J269 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
A0A0B4J269 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
A0A0B4J269 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
A0A0B4J269 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
A0A0B4J269 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
A0A0B4J269 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
A0A0B4J269 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
A0A0B4J269 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
A0A0B4J269 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
A0A0B4J269 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
A0A0B4J269 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
A0A0B4J269 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
A0A0B4J269 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
A0A0B4J269 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
A0A0B4J269 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
A0A0B4J269 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
A0A0B4J269 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
A0A0B4J269 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
A0A0B4J269 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
A0A0B4J269 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
A0A0B4J269 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
A0A0B4J269 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
A0A0B4J269 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
A0A0B4J269 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
A0A0B4J269 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
A0A0B4J269 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
A0A0B4J269 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
A0A0B4J269 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
A0A0B4J269 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
A0A0B4J269 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
A0A0B4J269 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
A0A0B4J269 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
A0A0B4J269 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
A0A0B4J269 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
A0A0B4J269 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
A0A0B4J269 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
A0A0B4J269 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
A0A0B4J269 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
A0A0B4J269 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
A0A0B4J269 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
A0A0B4J269 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
A0A0B4J269 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
A0A0B4J269 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
A0A0B4J269 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
A0A0B4J269 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
A0A0B4J269 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
A0A0B4J269 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms