Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4B4

RAD54L2, Helicase ARIP4, humanhuman

Predictions only

Length 1,467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD54L2Q9Y4B4 HHLA3-202ENST00000361764 692 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RAD54L2Q9Y4B4 IFNLR1-203ENST00000374418 674 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RAD54L2Q9Y4B4 KRTAP10-5-201ENST00000400372 1150 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RAD54L2Q9Y4B4 Z82188.2-201ENST00000419128 630 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RAD54L2Q9Y4B4 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RAD54L2Q9Y4B4 SEC61B-203ENST00000498603 587 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RAD54L2Q9Y4B4 MIR2278-201ENST00000516344 96 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
RAD54L2Q9Y4B4 AP004550.1-201ENST00000532652 514 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RAD54L2Q9Y4B4 RPL18-205ENST00000549273 1036 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RAD54L2Q9Y4B4 AC092073.1-202ENST00000606020 653 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RAD54L2Q9Y4B4 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
RAD54L2Q9Y4B4 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RAD54L2Q9Y4B4 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RAD54L2Q9Y4B4 TMEM56-RWDD3-202ENST00000604534 1491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RAD54L2Q9Y4B4 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RAD54L2Q9Y4B4 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RAD54L2Q9Y4B4 MSRA-201ENST00000317173 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RAD54L2Q9Y4B4 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RAD54L2Q9Y4B4 TBC1D27-202ENST00000424239 1573 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
RAD54L2Q9Y4B4 ARRB2-218ENST00000575877 1579 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RAD54L2Q9Y4B4 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RAD54L2Q9Y4B4 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RAD54L2Q9Y4B4 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RAD54L2Q9Y4B4 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAD54L2Q9Y4B4 DSG1-202ENST00000462981 1857 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAD54L2Q9Y4B4 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAD54L2Q9Y4B4 GUCY1B2-205ENST00000532104 1912 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAD54L2Q9Y4B4 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAD54L2Q9Y4B4 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAD54L2Q9Y4B4 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAD54L2Q9Y4B4 POLR2G-201ENST00000301788 827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAD54L2Q9Y4B4 TSC22D3-202ENST00000372382 1216 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAD54L2Q9Y4B4 FAM138B-202ENST00000446648 1130 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAD54L2Q9Y4B4 FAM138C-202ENST00000449442 1126 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAD54L2Q9Y4B4 PILRA-205ENST00000453419 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAD54L2Q9Y4B4 HOXC-AS3-203ENST00000514702 368 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAD54L2Q9Y4B4 AC113133.1-201ENST00000522388 1088 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAD54L2Q9Y4B4 AC078814.4-201ENST00000546650 327 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
RAD54L2Q9Y4B4 LINC01490-202ENST00000551399 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAD54L2Q9Y4B4 AC011921.1-201ENST00000559739 557 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAD54L2Q9Y4B4 MIR4254-201ENST00000581063 76 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
RAD54L2Q9Y4B4 AP000356.3-203ENST00000614808 601 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAD54L2Q9Y4B4 AC020904.3-201ENST00000624199 442 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
RAD54L2Q9Y4B4 FAM138F-201ENST00000631376 1183 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAD54L2Q9Y4B4 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAD54L2Q9Y4B4 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAD54L2Q9Y4B4 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAD54L2Q9Y4B4 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
RAD54L2Q9Y4B4 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAD54L2Q9Y4B4 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAD54L2Q9Y4B4 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAD54L2Q9Y4B4 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAD54L2Q9Y4B4 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RAD54L2Q9Y4B4 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RAD54L2Q9Y4B4 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RAD54L2Q9Y4B4 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RAD54L2Q9Y4B4 HPSE2-206ENST00000628193 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RAD54L2Q9Y4B4 ZNF556-202ENST00000586426 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RAD54L2Q9Y4B4 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RAD54L2Q9Y4B4 SIRPB3P-201ENST00000340424 1216 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
RAD54L2Q9Y4B4 MORN2-201ENST00000340556 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RAD54L2Q9Y4B4 IGHV1-3-201ENST00000390595 395 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RAD54L2Q9Y4B4 Z82249.1-201ENST00000453866 568 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RAD54L2Q9Y4B4 BLOC1S1-202ENST00000548556 525 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RAD54L2Q9Y4B4 BMF-206ENST00000558774 671 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RAD54L2Q9Y4B4 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RAD54L2Q9Y4B4 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
RAD54L2Q9Y4B4 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
RAD54L2Q9Y4B4 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
RAD54L2Q9Y4B4 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
RAD54L2Q9Y4B4 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RAD54L2Q9Y4B4 LDB3-204ENST00000372066 1598 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RAD54L2Q9Y4B4 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RAD54L2Q9Y4B4 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RAD54L2Q9Y4B4 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RAD54L2Q9Y4B4 NECTIN1-203ENST00000341398 1377 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RAD54L2Q9Y4B4 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RAD54L2Q9Y4B4 CSHL1-201ENST00000259003 739 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RAD54L2Q9Y4B4 ATP5H-202ENST00000344546 553 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RAD54L2Q9Y4B4 AL365500.1-201ENST00000442783 868 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RAD54L2Q9Y4B4 GS1-124K5.4-201ENST00000445681 540 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RAD54L2Q9Y4B4 SHMT2-203ENST00000449049 2121 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RAD54L2Q9Y4B4 AL451069.3-201ENST00000450206 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RAD54L2Q9Y4B4 CSHL1-206ENST00000450719 973 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RAD54L2Q9Y4B4 RN7SL351P-201ENST00000469306 248 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
RAD54L2Q9Y4B4 FXYD6-208ENST00000529335 708 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RAD54L2Q9Y4B4 SRP14-208ENST00000560773 468 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RAD54L2Q9Y4B4 RPL18A-203ENST00000599870 1084 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RAD54L2Q9Y4B4 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RAD54L2Q9Y4B4 NBAT1-201ENST00000566912 1940 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RAD54L2Q9Y4B4 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RAD54L2Q9Y4B4 SLC20A2-207ENST00000520179 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RAD54L2Q9Y4B4 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RAD54L2Q9Y4B4 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RAD54L2Q9Y4B4 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RAD54L2Q9Y4B4 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
RAD54L2Q9Y4B4 KRTAP6-1-201ENST00000329122 500 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RAD54L2Q9Y4B4 AL121987.1-201ENST00000435580 645 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RAD54L2Q9Y4B4 DHDDS-217ENST00000526219 1072 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RAD54L2Q9Y4B4 AC009055.1-201ENST00000562656 781 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms