Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSD4

ZNF275, Zinc finger protein 275, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 429 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF275Q9NSD4 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ZNF275Q9NSD4 SFRP1-202ENST00000379845 3873 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ZNF275Q9NSD4 TBC1D22A-201ENST00000337137 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ZNF275Q9NSD4 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ZNF275Q9NSD4 SLC22A12-202ENST00000377567 2599 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ZNF275Q9NSD4 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ZNF275Q9NSD4 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ZNF275Q9NSD4 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ZNF275Q9NSD4 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ZNF275Q9NSD4 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ZNF275Q9NSD4 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ZNF275Q9NSD4 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ZNF275Q9NSD4 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ZNF275Q9NSD4 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ZNF275Q9NSD4 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ZNF275Q9NSD4 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ZNF275Q9NSD4 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ZNF275Q9NSD4 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
ZNF275Q9NSD4 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ZNF275Q9NSD4 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ZNF275Q9NSD4 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ZNF275Q9NSD4 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ZNF275Q9NSD4 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ZNF275Q9NSD4 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ZNF275Q9NSD4 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
ZNF275Q9NSD4 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
ZNF275Q9NSD4 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
ZNF275Q9NSD4 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ZNF275Q9NSD4 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ZNF275Q9NSD4 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ZNF275Q9NSD4 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ZNF275Q9NSD4 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ZNF275Q9NSD4 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ZNF275Q9NSD4 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ZNF275Q9NSD4 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ZNF275Q9NSD4 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ZNF275Q9NSD4 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ZNF275Q9NSD4 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ZNF275Q9NSD4 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ZNF275Q9NSD4 FBXL19-201ENST00000338343 3965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ZNF275Q9NSD4 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ZNF275Q9NSD4 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ZNF275Q9NSD4 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ZNF275Q9NSD4 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ZNF275Q9NSD4 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ZNF275Q9NSD4 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ZNF275Q9NSD4 AL355390.1-201ENST00000325811 2328 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ZNF275Q9NSD4 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ZNF275Q9NSD4 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ZNF275Q9NSD4 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ZNF275Q9NSD4 B4GALT6-201ENST00000237019 2128 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ZNF275Q9NSD4 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ZNF275Q9NSD4 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
ZNF275Q9NSD4 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ZNF275Q9NSD4 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ZNF275Q9NSD4 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ZNF275Q9NSD4 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ZNF275Q9NSD4 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ZNF275Q9NSD4 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ZNF275Q9NSD4 ALDH3A2-226ENST00000631291 3822 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ZNF275Q9NSD4 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ZNF275Q9NSD4 DYRK1B-202ENST00000348817 2448 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ZNF275Q9NSD4 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ZNF275Q9NSD4 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ZNF275Q9NSD4 CARHSP1-217ENST00000611932 2833 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ZNF275Q9NSD4 ZBTB2-201ENST00000325144 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ZNF275Q9NSD4 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ZNF275Q9NSD4 CYB5D1-203ENST00000571846 1870 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ZNF275Q9NSD4 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ZNF275Q9NSD4 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ZNF275Q9NSD4 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ZNF275Q9NSD4 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ZNF275Q9NSD4 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ZNF275Q9NSD4 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ZNF275Q9NSD4 SYBU-204ENST00000408908 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ZNF275Q9NSD4 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ZNF275Q9NSD4 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ZNF275Q9NSD4 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
ZNF275Q9NSD4 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
ZNF275Q9NSD4 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ZNF275Q9NSD4 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ZNF275Q9NSD4 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ZNF275Q9NSD4 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ZNF275Q9NSD4 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
ZNF275Q9NSD4 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ZNF275Q9NSD4 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ZNF275Q9NSD4 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ZNF275Q9NSD4 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
ZNF275Q9NSD4 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ZNF275Q9NSD4 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ZNF275Q9NSD4 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ZNF275Q9NSD4 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ZNF275Q9NSD4 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ZNF275Q9NSD4 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ZNF275Q9NSD4 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ZNF275Q9NSD4 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ZNF275Q9NSD4 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ZNF275Q9NSD4 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ZNF275Q9NSD4 EHMT2-201ENST00000375528 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ZNF275Q9NSD4 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms