Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQY4

RHOXF2, Rhox homeobox family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOXF2Q9BQY4 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RHOXF2Q9BQY4 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RHOXF2Q9BQY4 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RHOXF2Q9BQY4 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RHOXF2Q9BQY4 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RHOXF2Q9BQY4 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RHOXF2Q9BQY4 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RHOXF2Q9BQY4 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RHOXF2Q9BQY4 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RHOXF2Q9BQY4 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RHOXF2Q9BQY4 AP002761.4-201ENST00000565433 3361 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RHOXF2Q9BQY4 SLC22A23-202ENST00000380302 2883 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RHOXF2Q9BQY4 USP19-207ENST00000434032 4677 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RHOXF2Q9BQY4 RIMS1-218ENST00000522291 3876 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RHOXF2Q9BQY4 NINL-203ENST00000422516 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RHOXF2Q9BQY4 GEM-201ENST00000297596 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RHOXF2Q9BQY4 NRG1-201ENST00000287842 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RHOXF2Q9BQY4 TRIM26-267ENST00000453195 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RHOXF2Q9BQY4 PCDHA6-201ENST00000378126 3267 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RHOXF2Q9BQY4 CAP1-203ENST00000372797 3105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RHOXF2Q9BQY4 TP73-207ENST00000378290 1831 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RHOXF2Q9BQY4 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RHOXF2Q9BQY4 PSAP-202ENST00000394936 2872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RHOXF2Q9BQY4 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RHOXF2Q9BQY4 RIPK4-201ENST00000332512 3889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RHOXF2Q9BQY4 MLPH-201ENST00000264605 3823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RHOXF2Q9BQY4 GGT1-203ENST00000400382 2628 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RHOXF2Q9BQY4 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RHOXF2Q9BQY4 PPFIA4-203ENST00000367240 6434 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RHOXF2Q9BQY4 SLC45A1-201ENST00000289877 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RHOXF2Q9BQY4 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RHOXF2Q9BQY4 CYP4F3-201ENST00000221307 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RHOXF2Q9BQY4 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RHOXF2Q9BQY4 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
RHOXF2Q9BQY4 AMT-201ENST00000273588 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RHOXF2Q9BQY4 SUPT7L-203ENST00000405491 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RHOXF2Q9BQY4 MBP-205ENST00000397860 4844 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RHOXF2Q9BQY4 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RHOXF2Q9BQY4 SEMA3F-201ENST00000002829 3802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RHOXF2Q9BQY4 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RHOXF2Q9BQY4 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RHOXF2Q9BQY4 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RHOXF2Q9BQY4 TKFC-201ENST00000394900 4696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RHOXF2Q9BQY4 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
RHOXF2Q9BQY4 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RHOXF2Q9BQY4 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
RHOXF2Q9BQY4 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RHOXF2Q9BQY4 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RHOXF2Q9BQY4 ZNF721-205ENST00000511833 2966 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RHOXF2Q9BQY4 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RHOXF2Q9BQY4 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RHOXF2Q9BQY4 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RHOXF2Q9BQY4 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RHOXF2Q9BQY4 SIPA1L3-201ENST00000222345 7987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RHOXF2Q9BQY4 AL731571.1-201ENST00000617058 5428 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
RHOXF2Q9BQY4 LAMP2-203ENST00000434600 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RHOXF2Q9BQY4 SLC29A4-201ENST00000297195 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RHOXF2Q9BQY4 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RHOXF2Q9BQY4 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RHOXF2Q9BQY4 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RHOXF2Q9BQY4 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RHOXF2Q9BQY4 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RHOXF2Q9BQY4 NR4A2-209ENST00000426264 2642 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RHOXF2Q9BQY4 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RHOXF2Q9BQY4 PAX2-202ENST00000361791 3193 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RHOXF2Q9BQY4 DISC1-221ENST00000620189 6689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RHOXF2Q9BQY4 EIF3CL-201ENST00000380876 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RHOXF2Q9BQY4 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RHOXF2Q9BQY4 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RHOXF2Q9BQY4 MICB-202ENST00000399150 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RHOXF2Q9BQY4 SPATA7-217ENST00000556553 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RHOXF2Q9BQY4 SYK-203ENST00000375751 4936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RHOXF2Q9BQY4 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RHOXF2Q9BQY4 ZNF501-205ENST00000620116 3382 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RHOXF2Q9BQY4 PTH2R-201ENST00000272847 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RHOXF2Q9BQY4 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RHOXF2Q9BQY4 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RHOXF2Q9BQY4 PRR29-202ENST00000412177 3127 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RHOXF2Q9BQY4 GABPA-202ENST00000400075 4814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RHOXF2Q9BQY4 COASY-211ENST00000590958 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RHOXF2Q9BQY4 C21orf59-203ENST00000382549 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RHOXF2Q9BQY4 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RHOXF2Q9BQY4 AGAP12P-201ENST00000585227 2359 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
RHOXF2Q9BQY4 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RHOXF2Q9BQY4 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RHOXF2Q9BQY4 TRIB2-201ENST00000155926 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RHOXF2Q9BQY4 CA12-201ENST00000178638 6413 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RHOXF2Q9BQY4 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RHOXF2Q9BQY4 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
RHOXF2Q9BQY4 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RHOXF2Q9BQY4 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RHOXF2Q9BQY4 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RHOXF2Q9BQY4 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RHOXF2Q9BQY4 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RHOXF2Q9BQY4 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RHOXF2Q9BQY4 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
RHOXF2Q9BQY4 FAM122B-201ENST00000298090 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RHOXF2Q9BQY4 YWHAQ-201ENST00000238081 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RHOXF2Q9BQY4 AL021395.1-201ENST00000611791 2232 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RHOXF2Q9BQY4 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.4 ms