Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI5

SGIP1, SH3-containing GRB2-like protein 3-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGIP1Q9BQI5 AC133552.4-201ENST00000576103 676 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SGIP1Q9BQI5 LINC00969-241ENST00000600527 852 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SGIP1Q9BQI5 LINC00969-322ENST00000630170 584 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SGIP1Q9BQI5 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SGIP1Q9BQI5 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SGIP1Q9BQI5 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SGIP1Q9BQI5 AKR1C2-202ENST00000421196 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SGIP1Q9BQI5 AC092809.4-201ENST00000420350 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SGIP1Q9BQI5 COLCA2-202ENST00000526216 1332 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SGIP1Q9BQI5 DAO-208ENST00000551281 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SGIP1Q9BQI5 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SGIP1Q9BQI5 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SGIP1Q9BQI5 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SGIP1Q9BQI5 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SGIP1Q9BQI5 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SGIP1Q9BQI5 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SGIP1Q9BQI5 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SGIP1Q9BQI5 GFI1B-203ENST00000372123 1514 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SGIP1Q9BQI5 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SGIP1Q9BQI5 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SGIP1Q9BQI5 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SGIP1Q9BQI5 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SGIP1Q9BQI5 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SGIP1Q9BQI5 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SGIP1Q9BQI5 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
SGIP1Q9BQI5 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SGIP1Q9BQI5 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SGIP1Q9BQI5 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SGIP1Q9BQI5 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SGIP1Q9BQI5 CELA3A-201ENST00000290122 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SGIP1Q9BQI5 FAM163B-201ENST00000356873 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SGIP1Q9BQI5 MIR339-201ENST00000362153 94 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
SGIP1Q9BQI5 TPM3-211ENST00000368531 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SGIP1Q9BQI5 ABCD1P4-201ENST00000399687 604 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
SGIP1Q9BQI5 CYCS-203ENST00000409764 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SGIP1Q9BQI5 AC026884.1-201ENST00000418296 457 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
SGIP1Q9BQI5 AL022332.1-202ENST00000432495 426 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SGIP1Q9BQI5 CCND3P1-201ENST00000438347 580 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
SGIP1Q9BQI5 YY1P2-201ENST00000438766 948 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
SGIP1Q9BQI5 CUTA-204ENST00000440279 822 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SGIP1Q9BQI5 KCNC4-AS1-201ENST00000455967 748 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SGIP1Q9BQI5 RN7SL684P-201ENST00000465665 294 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
SGIP1Q9BQI5 RN7SL351P-201ENST00000469306 248 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
SGIP1Q9BQI5 MARK2P17-201ENST00000498560 841 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
SGIP1Q9BQI5 CRYBB2P1-204ENST00000509460 701 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SGIP1Q9BQI5 OR52V1P-201ENST00000515557 898 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
SGIP1Q9BQI5 STAU2-212ENST00000521419 972 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SGIP1Q9BQI5 MST1L-204ENST00000545160 559 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SGIP1Q9BQI5 AC140912.1-202ENST00000561802 194 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SGIP1Q9BQI5 Metazoa_SRP.128-201ENST00000620543 314 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
SGIP1Q9BQI5 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SGIP1Q9BQI5 DEDD-202ENST00000368006 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SGIP1Q9BQI5 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SGIP1Q9BQI5 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SGIP1Q9BQI5 ZNF720-202ENST00000398696 1339 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SGIP1Q9BQI5 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SGIP1Q9BQI5 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SGIP1Q9BQI5 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SGIP1Q9BQI5 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SGIP1Q9BQI5 SLC25A31-201ENST00000281154 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SGIP1Q9BQI5 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SGIP1Q9BQI5 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SGIP1Q9BQI5 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SGIP1Q9BQI5 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SGIP1Q9BQI5 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SGIP1Q9BQI5 SSR4-202ENST00000370085 526 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SGIP1Q9BQI5 CCL19-202ENST00000378800 414 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SGIP1Q9BQI5 PCLAF-202ENST00000380258 911 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SGIP1Q9BQI5 VPREB1-202ENST00000403807 755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SGIP1Q9BQI5 TEX33-203ENST00000405091 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SGIP1Q9BQI5 AC147651.3-201ENST00000429872 731 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SGIP1Q9BQI5 AL162725.2-201ENST00000430545 748 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SGIP1Q9BQI5 BTG3P1-201ENST00000435859 716 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
SGIP1Q9BQI5 RN7SL363P-201ENST00000482412 273 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
SGIP1Q9BQI5 AC253576.1-201ENST00000511645 1156 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
SGIP1Q9BQI5 AC087442.1-201ENST00000525563 249 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SGIP1Q9BQI5 GACAT2-201ENST00000579368 818 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SGIP1Q9BQI5 AC010618.2-201ENST00000596192 460 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SGIP1Q9BQI5 ZFAS1-208ENST00000618800 597 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SGIP1Q9BQI5 AC079331.1-201ENST00000623200 1200 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
SGIP1Q9BQI5 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SGIP1Q9BQI5 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SGIP1Q9BQI5 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SGIP1Q9BQI5 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SGIP1Q9BQI5 HERPUD1-203ENST00000379792 1782 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SGIP1Q9BQI5 GNG4-201ENST00000366597 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SGIP1Q9BQI5 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SGIP1Q9BQI5 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SGIP1Q9BQI5 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SGIP1Q9BQI5 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SGIP1Q9BQI5 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SGIP1Q9BQI5 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SGIP1Q9BQI5 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SGIP1Q9BQI5 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SGIP1Q9BQI5 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SGIP1Q9BQI5 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SGIP1Q9BQI5 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SGIP1Q9BQI5 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SGIP1Q9BQI5 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SGIP1Q9BQI5 SLC13A5-202ENST00000381074 1738 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 324.9 ms