Protein–RNA interactions for Protein: Q96S38

RPS6KC1, Ribosomal protein S6 kinase delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KC1Q96S38 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPS6KC1Q96S38 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPS6KC1Q96S38 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPS6KC1Q96S38 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPS6KC1Q96S38 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPS6KC1Q96S38 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPS6KC1Q96S38 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPS6KC1Q96S38 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
RPS6KC1Q96S38 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPS6KC1Q96S38 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPS6KC1Q96S38 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPS6KC1Q96S38 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPS6KC1Q96S38 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPS6KC1Q96S38 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPS6KC1Q96S38 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPS6KC1Q96S38 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPS6KC1Q96S38 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPS6KC1Q96S38 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPS6KC1Q96S38 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPS6KC1Q96S38 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPS6KC1Q96S38 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPS6KC1Q96S38 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPS6KC1Q96S38 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
RPS6KC1Q96S38 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPS6KC1Q96S38 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
RPS6KC1Q96S38 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
RPS6KC1Q96S38 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPS6KC1Q96S38 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPS6KC1Q96S38 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPS6KC1Q96S38 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPS6KC1Q96S38 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPS6KC1Q96S38 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
RPS6KC1Q96S38 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
RPS6KC1Q96S38 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
RPS6KC1Q96S38 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPS6KC1Q96S38 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPS6KC1Q96S38 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPS6KC1Q96S38 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPS6KC1Q96S38 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPS6KC1Q96S38 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPS6KC1Q96S38 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPS6KC1Q96S38 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPS6KC1Q96S38 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPS6KC1Q96S38 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPS6KC1Q96S38 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPS6KC1Q96S38 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPS6KC1Q96S38 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPS6KC1Q96S38 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPS6KC1Q96S38 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPS6KC1Q96S38 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPS6KC1Q96S38 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPS6KC1Q96S38 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPS6KC1Q96S38 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
RPS6KC1Q96S38 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPS6KC1Q96S38 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPS6KC1Q96S38 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
RPS6KC1Q96S38 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPS6KC1Q96S38 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPS6KC1Q96S38 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPS6KC1Q96S38 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
RPS6KC1Q96S38 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPS6KC1Q96S38 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPS6KC1Q96S38 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPS6KC1Q96S38 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
RPS6KC1Q96S38 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPS6KC1Q96S38 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPS6KC1Q96S38 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPS6KC1Q96S38 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPS6KC1Q96S38 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPS6KC1Q96S38 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPS6KC1Q96S38 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPS6KC1Q96S38 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPS6KC1Q96S38 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPS6KC1Q96S38 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPS6KC1Q96S38 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPS6KC1Q96S38 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPS6KC1Q96S38 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPS6KC1Q96S38 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
RPS6KC1Q96S38 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPS6KC1Q96S38 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
RPS6KC1Q96S38 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPS6KC1Q96S38 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPS6KC1Q96S38 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPS6KC1Q96S38 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPS6KC1Q96S38 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPS6KC1Q96S38 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPS6KC1Q96S38 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
RPS6KC1Q96S38 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPS6KC1Q96S38 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPS6KC1Q96S38 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPS6KC1Q96S38 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPS6KC1Q96S38 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
RPS6KC1Q96S38 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
RPS6KC1Q96S38 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
RPS6KC1Q96S38 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPS6KC1Q96S38 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPS6KC1Q96S38 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPS6KC1Q96S38 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPS6KC1Q96S38 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPS6KC1Q96S38 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.8 ms