Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD1

SGCZ, Zeta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCZQ96LD1 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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SGCZQ96LD1 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SGCZQ96LD1 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
SGCZQ96LD1 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SGCZQ96LD1 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SGCZQ96LD1 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SGCZQ96LD1 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SGCZQ96LD1 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SGCZQ96LD1 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SGCZQ96LD1 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SGCZQ96LD1 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
SGCZQ96LD1 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
SGCZQ96LD1 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
SGCZQ96LD1 KIAA0319-204ENST00000537886 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SGCZQ96LD1 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SGCZQ96LD1 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
SGCZQ96LD1 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SGCZQ96LD1 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SGCZQ96LD1 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SGCZQ96LD1 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SGCZQ96LD1 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SGCZQ96LD1 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SGCZQ96LD1 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SGCZQ96LD1 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SGCZQ96LD1 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SGCZQ96LD1 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SGCZQ96LD1 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SGCZQ96LD1 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SGCZQ96LD1 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SGCZQ96LD1 PID1-202ENST00000392054 2745 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SGCZQ96LD1 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SGCZQ96LD1 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SGCZQ96LD1 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SGCZQ96LD1 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SGCZQ96LD1 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SGCZQ96LD1 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SGCZQ96LD1 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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SGCZQ96LD1 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SGCZQ96LD1 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SGCZQ96LD1 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SGCZQ96LD1 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SGCZQ96LD1 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SGCZQ96LD1 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SGCZQ96LD1 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SGCZQ96LD1 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SGCZQ96LD1 OTOF-202ENST00000338581 4954 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SGCZQ96LD1 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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SGCZQ96LD1 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SGCZQ96LD1 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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SGCZQ96LD1 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SGCZQ96LD1 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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SGCZQ96LD1 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
SGCZQ96LD1 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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SGCZQ96LD1 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SGCZQ96LD1 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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SGCZQ96LD1 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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SGCZQ96LD1 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SGCZQ96LD1 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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SGCZQ96LD1 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SGCZQ96LD1 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SGCZQ96LD1 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SGCZQ96LD1 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SGCZQ96LD1 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SGCZQ96LD1 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SGCZQ96LD1 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SGCZQ96LD1 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SGCZQ96LD1 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SGCZQ96LD1 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
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SGCZQ96LD1 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SGCZQ96LD1 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SGCZQ96LD1 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SGCZQ96LD1 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SGCZQ96LD1 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SGCZQ96LD1 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SGCZQ96LD1 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SGCZQ96LD1 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SGCZQ96LD1 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SGCZQ96LD1 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SGCZQ96LD1 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SGCZQ96LD1 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
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