Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTX7

CATSPER4, Cation channel sperm-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CATSPER4Q7RTX7 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CATSPER4Q7RTX7 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CATSPER4Q7RTX7 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CATSPER4Q7RTX7 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CATSPER4Q7RTX7 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CATSPER4Q7RTX7 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CATSPER4Q7RTX7 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CATSPER4Q7RTX7 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CATSPER4Q7RTX7 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CATSPER4Q7RTX7 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CATSPER4Q7RTX7 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CATSPER4Q7RTX7 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CATSPER4Q7RTX7 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CATSPER4Q7RTX7 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CATSPER4Q7RTX7 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CATSPER4Q7RTX7 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CATSPER4Q7RTX7 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CATSPER4Q7RTX7 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
CATSPER4Q7RTX7 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CATSPER4Q7RTX7 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CATSPER4Q7RTX7 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CATSPER4Q7RTX7 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CATSPER4Q7RTX7 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CATSPER4Q7RTX7 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CATSPER4Q7RTX7 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CATSPER4Q7RTX7 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CATSPER4Q7RTX7 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CATSPER4Q7RTX7 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CATSPER4Q7RTX7 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CATSPER4Q7RTX7 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CATSPER4Q7RTX7 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CATSPER4Q7RTX7 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CATSPER4Q7RTX7 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CATSPER4Q7RTX7 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CATSPER4Q7RTX7 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CATSPER4Q7RTX7 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CATSPER4Q7RTX7 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CATSPER4Q7RTX7 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CATSPER4Q7RTX7 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CATSPER4Q7RTX7 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CATSPER4Q7RTX7 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CATSPER4Q7RTX7 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CATSPER4Q7RTX7 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CATSPER4Q7RTX7 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CATSPER4Q7RTX7 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CATSPER4Q7RTX7 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CATSPER4Q7RTX7 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CATSPER4Q7RTX7 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CATSPER4Q7RTX7 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CATSPER4Q7RTX7 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CATSPER4Q7RTX7 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CATSPER4Q7RTX7 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CATSPER4Q7RTX7 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CATSPER4Q7RTX7 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CATSPER4Q7RTX7 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CATSPER4Q7RTX7 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CATSPER4Q7RTX7 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CATSPER4Q7RTX7 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CATSPER4Q7RTX7 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CATSPER4Q7RTX7 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CATSPER4Q7RTX7 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CATSPER4Q7RTX7 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CATSPER4Q7RTX7 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CATSPER4Q7RTX7 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CATSPER4Q7RTX7 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CATSPER4Q7RTX7 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CATSPER4Q7RTX7 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CATSPER4Q7RTX7 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CATSPER4Q7RTX7 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CATSPER4Q7RTX7 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CATSPER4Q7RTX7 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CATSPER4Q7RTX7 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CATSPER4Q7RTX7 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CATSPER4Q7RTX7 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CATSPER4Q7RTX7 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CATSPER4Q7RTX7 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CATSPER4Q7RTX7 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CATSPER4Q7RTX7 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CATSPER4Q7RTX7 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CATSPER4Q7RTX7 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CATSPER4Q7RTX7 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CATSPER4Q7RTX7 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CATSPER4Q7RTX7 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CATSPER4Q7RTX7 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CATSPER4Q7RTX7 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CATSPER4Q7RTX7 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CATSPER4Q7RTX7 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CATSPER4Q7RTX7 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CATSPER4Q7RTX7 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CATSPER4Q7RTX7 AL353770.1-201ENST00000614915 403 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CATSPER4Q7RTX7 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CATSPER4Q7RTX7 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CATSPER4Q7RTX7 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CATSPER4Q7RTX7 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CATSPER4Q7RTX7 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CATSPER4Q7RTX7 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CATSPER4Q7RTX7 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CATSPER4Q7RTX7 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CATSPER4Q7RTX7 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CATSPER4Q7RTX7 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms