Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTM1

OTOP1, Otopetrin-1, humanhuman

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTOP1Q7RTM1 AQP7P3-201ENST00000624547 1041 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
OTOP1Q7RTM1 AC114296.1-204ENST00000637197 1173 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
OTOP1Q7RTM1 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
OTOP1Q7RTM1 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
OTOP1Q7RTM1 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
OTOP1Q7RTM1 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
OTOP1Q7RTM1 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
OTOP1Q7RTM1 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
OTOP1Q7RTM1 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
OTOP1Q7RTM1 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
OTOP1Q7RTM1 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
OTOP1Q7RTM1 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
OTOP1Q7RTM1 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
OTOP1Q7RTM1 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
OTOP1Q7RTM1 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
OTOP1Q7RTM1 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
OTOP1Q7RTM1 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
OTOP1Q7RTM1 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
OTOP1Q7RTM1 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
OTOP1Q7RTM1 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
OTOP1Q7RTM1 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
OTOP1Q7RTM1 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
OTOP1Q7RTM1 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
OTOP1Q7RTM1 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
OTOP1Q7RTM1 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
OTOP1Q7RTM1 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
OTOP1Q7RTM1 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
OTOP1Q7RTM1 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
OTOP1Q7RTM1 PRIMA1-201ENST00000316227 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
OTOP1Q7RTM1 C7orf61-201ENST00000332375 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
OTOP1Q7RTM1 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
OTOP1Q7RTM1 Z99943.1-201ENST00000451545 718 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
OTOP1Q7RTM1 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
OTOP1Q7RTM1 TMEM222-204ENST00000466759 368 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
OTOP1Q7RTM1 AC114947.1-202ENST00000514136 344 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
OTOP1Q7RTM1 AP003068.3-201ENST00000527789 175 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
OTOP1Q7RTM1 AC020659.1-202ENST00000564432 531 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
OTOP1Q7RTM1 TMEM98-205ENST00000578289 806 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
OTOP1Q7RTM1 HIST1H3F-201ENST00000618052 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
OTOP1Q7RTM1 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
OTOP1Q7RTM1 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
OTOP1Q7RTM1 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
OTOP1Q7RTM1 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
OTOP1Q7RTM1 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
OTOP1Q7RTM1 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
OTOP1Q7RTM1 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
OTOP1Q7RTM1 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
OTOP1Q7RTM1 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
OTOP1Q7RTM1 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
OTOP1Q7RTM1 LINC01815-202ENST00000641468 1409 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
OTOP1Q7RTM1 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
OTOP1Q7RTM1 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
OTOP1Q7RTM1 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
OTOP1Q7RTM1 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
OTOP1Q7RTM1 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
OTOP1Q7RTM1 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
OTOP1Q7RTM1 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
OTOP1Q7RTM1 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
OTOP1Q7RTM1 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
OTOP1Q7RTM1 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
OTOP1Q7RTM1 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
OTOP1Q7RTM1 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
OTOP1Q7RTM1 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
OTOP1Q7RTM1 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
OTOP1Q7RTM1 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
OTOP1Q7RTM1 TMEM144-209ENST00000509278 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
OTOP1Q7RTM1 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
OTOP1Q7RTM1 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
OTOP1Q7RTM1 AURKB-201ENST00000316199 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
OTOP1Q7RTM1 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
OTOP1Q7RTM1 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
OTOP1Q7RTM1 RNF216P1-212ENST00000493407 659 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
OTOP1Q7RTM1 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
OTOP1Q7RTM1 AC069185.1-202ENST00000533405 471 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
OTOP1Q7RTM1 AC134312.2-201ENST00000563521 608 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
OTOP1Q7RTM1 AC136944.4-201ENST00000568893 660 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
OTOP1Q7RTM1 AC055811.3-201ENST00000584952 686 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
OTOP1Q7RTM1 ZNF350-AS1-202ENST00000600253 577 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
OTOP1Q7RTM1 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
OTOP1Q7RTM1 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
OTOP1Q7RTM1 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
OTOP1Q7RTM1 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
OTOP1Q7RTM1 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
OTOP1Q7RTM1 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
OTOP1Q7RTM1 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
OTOP1Q7RTM1 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
OTOP1Q7RTM1 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
OTOP1Q7RTM1 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
OTOP1Q7RTM1 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
OTOP1Q7RTM1 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
OTOP1Q7RTM1 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
OTOP1Q7RTM1 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
OTOP1Q7RTM1 AL513327.1-206ENST00000587696 1432 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
OTOP1Q7RTM1 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
OTOP1Q7RTM1 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
OTOP1Q7RTM1 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
OTOP1Q7RTM1 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
OTOP1Q7RTM1 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
OTOP1Q7RTM1 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
OTOP1Q7RTM1 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 154.6 ms