Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWN6

FAM208B, Protein FAM208B, humanhuman

Predictions only

Length 2,430 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM208BQ5VWN6 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
FAM208BQ5VWN6 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
FAM208BQ5VWN6 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
FAM208BQ5VWN6 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
FAM208BQ5VWN6 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
FAM208BQ5VWN6 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
FAM208BQ5VWN6 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
FAM208BQ5VWN6 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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FAM208BQ5VWN6 GIMD1-201ENST00000507153 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
FAM208BQ5VWN6 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
FAM208BQ5VWN6 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
FAM208BQ5VWN6 NACA-221ENST00000552540 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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FAM208BQ5VWN6 AC010478.1-203ENST00000558403 532 ntTSL 4 BASIC13.01□□□□□ -0.33
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FAM208BQ5VWN6 RPS5-205ENST00000598495 800 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
FAM208BQ5VWN6 AL136982.5-201ENST00000605222 294 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
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FAM208BQ5VWN6 AC091905.3-201ENST00000624959 234 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
FAM208BQ5VWN6 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
FAM208BQ5VWN6 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
FAM208BQ5VWN6 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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FAM208BQ5VWN6 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
FAM208BQ5VWN6 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
FAM208BQ5VWN6 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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FAM208BQ5VWN6 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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FAM208BQ5VWN6 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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FAM208BQ5VWN6 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
FAM208BQ5VWN6 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
FAM208BQ5VWN6 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
FAM208BQ5VWN6 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
FAM208BQ5VWN6 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
FAM208BQ5VWN6 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
FAM208BQ5VWN6 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
FAM208BQ5VWN6 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
FAM208BQ5VWN6 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
FAM208BQ5VWN6 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
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