Protein–RNA interactions for Protein: Q502W7

CCDC38, Coiled-coil domain-containing protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC38Q502W7 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC38Q502W7 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC38Q502W7 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC38Q502W7 PXDN-201ENST00000252804 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC38Q502W7 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC38Q502W7 ATP12A-201ENST00000218548 3732 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC38Q502W7 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC38Q502W7 B3GNT5-202ENST00000460419 3368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC38Q502W7 PIP5K1B-208ENST00000541509 2664 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC38Q502W7 TRIM25-201ENST00000316881 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC38Q502W7 PCMTD2-204ENST00000369758 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC38Q502W7 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC38Q502W7 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC38Q502W7 UBE3A-224ENST00000635914 9352 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC38Q502W7 GALC-206ENST00000544807 2528 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC38Q502W7 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC38Q502W7 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC38Q502W7 ATRIP-204ENST00000412052 2721 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC38Q502W7 YIPF6-204ENST00000462683 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC38Q502W7 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC38Q502W7 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC38Q502W7 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC38Q502W7 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC38Q502W7 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC38Q502W7 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC38Q502W7 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC38Q502W7 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC38Q502W7 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC38Q502W7 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC38Q502W7 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC38Q502W7 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC38Q502W7 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC38Q502W7 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC38Q502W7 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC38Q502W7 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC38Q502W7 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC38Q502W7 SLC4A7-207ENST00000437179 3667 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC38Q502W7 IFITM10-201ENST00000340134 3706 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC38Q502W7 IRS1-201ENST00000305123 9705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC38Q502W7 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC38Q502W7 ZBTB20-215ENST00000481632 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC38Q502W7 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC38Q502W7 ISY1-203ENST00000393295 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC38Q502W7 DAGLB-201ENST00000297056 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC38Q502W7 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC38Q502W7 GNAS-213ENST00000371099 3709 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC38Q502W7 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC38Q502W7 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC38Q502W7 GMPPB-203ENST00000480687 6108 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC38Q502W7 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC38Q502W7 TNFAIP8L1-201ENST00000327473 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC38Q502W7 TNFAIP8L1-202ENST00000536716 3845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC38Q502W7 SLC1A7-202ENST00000371494 2637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC38Q502W7 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC38Q502W7 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC38Q502W7 SF1-201ENST00000227503 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC38Q502W7 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC38Q502W7 C8orf31-201ENST00000395172 1875 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC38Q502W7 ZNF395-201ENST00000344423 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC38Q502W7 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC38Q502W7 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC38Q502W7 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC38Q502W7 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC38Q502W7 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC38Q502W7 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC38Q502W7 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC38Q502W7 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC38Q502W7 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC38Q502W7 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC38Q502W7 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC38Q502W7 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC38Q502W7 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC38Q502W7 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC38Q502W7 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC38Q502W7 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC38Q502W7 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC38Q502W7 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC38Q502W7 RNF145-202ENST00000424310 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC38Q502W7 LRRC20-201ENST00000355790 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC38Q502W7 USP48-213ENST00000529637 3228 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC38Q502W7 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC38Q502W7 FBXO34-201ENST00000313833 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC38Q502W7 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC38Q502W7 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC38Q502W7 HECTD1-219ENST00000611816 8980 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC38Q502W7 ANGPTL2-202ENST00000373425 3707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC38Q502W7 EPS8L3-202ENST00000361965 1971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC38Q502W7 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC38Q502W7 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC38Q502W7 MAP7-204ENST00000454590 3119 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC38Q502W7 TMEM104-201ENST00000335464 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC38Q502W7 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC38Q502W7 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC38Q502W7 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC38Q502W7 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC38Q502W7 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC38Q502W7 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC38Q502W7 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC38Q502W7 TMEM47-201ENST00000275954 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC38Q502W7 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.9 ms