Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Length 1,050 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 ZBTB2-201ENST00000325144 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 TMEM231-207ENST00000568377 2920 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 RLIM-202ENST00000349225 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 HNRNPH1-203ENST00000393432 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 SOAT1-203ENST00000539888 6794 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 FLJ40288-201ENST00000332558 1998 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 USP44-203ENST00000537435 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 AC023794.5-201ENST00000564380 2157 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 ZFP2-201ENST00000361362 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 MEAF6-203ENST00000373074 2005 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 RAB11FIP1-206ENST00000524118 1959 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 AC126335.2-201ENST00000623362 4637 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
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