Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

Predictions only

Length 2,644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ATRQ13535 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
ATRQ13535 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ATRQ13535 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ATRQ13535 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ATRQ13535 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ATRQ13535 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ATRQ13535 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ATRQ13535 CMTM1-201ENST00000328020 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ATRQ13535 CMTM1-202ENST00000332695 624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ATRQ13535 CMTM1-205ENST00000379500 1064 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ATRQ13535 AC018814.1-201ENST00000418972 357 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
ATRQ13535 AC008750.2-201ENST00000526996 627 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
ATRQ13535 CMTM1-209ENST00000528324 749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ATRQ13535 CMTM1-217ENST00000533666 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ATRQ13535 AC008747.1-201ENST00000592220 442 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
ATRQ13535 Metazoa_SRP.156-201ENST00000622344 262 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
ATRQ13535 PNPT1-207ENST00000625249 216 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
ATRQ13535 CCDC32-215ENST00000625629 801 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
ATRQ13535 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ATRQ13535 C7orf57-201ENST00000348904 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ATRQ13535 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ATRQ13535 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ATRQ13535 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ATRQ13535 C22orf42-201ENST00000382097 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ATRQ13535 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
ATRQ13535 AC237221.1-201ENST00000561575 1881 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ATRQ13535 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
ATRQ13535 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ATRQ13535 VDAC2-202ENST00000313132 1467 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ATRQ13535 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ATRQ13535 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ATRQ13535 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
ATRQ13535 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ATRQ13535 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ATRQ13535 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ATRQ13535 S100B-201ENST00000291700 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ATRQ13535 HIST1H2BK-201ENST00000356950 381 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
ATRQ13535 GALP-201ENST00000357330 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ATRQ13535 GSTT2-201ENST00000402588 937 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ATRQ13535 AC231533.1-201ENST00000416061 925 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
ATRQ13535 FAM21EP-201ENST00000417804 985 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
ATRQ13535 GALP-202ENST00000440823 889 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
ATRQ13535 AC131235.2-201ENST00000445553 1057 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
ATRQ13535 IP6K2-223ENST00000453202 571 ntTSL 4 BASIC11.36□□□□□ -0.59
ATRQ13535 CU639417.1-201ENST00000464664 460 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
ATRQ13535 SEPHS2P1-201ENST00000511618 1162 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
ATRQ13535 WDYHV1-206ENST00000523356 869 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
ATRQ13535 AC037486.1-201ENST00000523792 790 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ATRQ13535 ACY3-202ENST00000529256 933 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
ATRQ13535 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ATRQ13535 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
ATRQ13535 ANAPC11-214ENST00000578544 403 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
ATRQ13535 H2BFS-201ENST00000599962 460 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
ATRQ13535 Metazoa_SRP.83-201ENST00000611762 320 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
ATRQ13535 AC005746.3-201ENST00000614751 393 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
ATRQ13535 AC106782.5-201ENST00000616011 337 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
ATRQ13535 Metazoa_SRP.37-201ENST00000617743 320 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
ATRQ13535 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
ATRQ13535 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
ATRQ13535 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
ATRQ13535 AC067931.2-201ENST00000623655 2003 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
ATRQ13535 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ATRQ13535 BRD7P5-201ENST00000299197 1822 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
ATRQ13535 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ATRQ13535 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ATRQ13535 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ATRQ13535 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
ATRQ13535 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
ATRQ13535 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ATRQ13535 GPN3-203ENST00000543199 1604 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
ATRQ13535 AC011287.1-201ENST00000639998 1349 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
ATRQ13535 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ATRQ13535 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ATRQ13535 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
ATRQ13535 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ATRQ13535 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ATRQ13535 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ATRQ13535 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
ATRQ13535 UBE2I-206ENST00000403747 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
ATRQ13535 AP000244.1-201ENST00000424582 201 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
ATRQ13535 CCDC12-202ENST00000425441 1097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
ATRQ13535 AC092910.2-201ENST00000491262 348 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
ATRQ13535 SMIM15-202ENST00000507416 584 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
ATRQ13535 MST1L-204ENST00000545160 559 ntTSL 4 BASIC11.35□□□□□ -0.59
ATRQ13535 LINC02352-201ENST00000557928 468 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
ATRQ13535 IDH3A-213ENST00000559205 566 ntTSL 4 BASIC11.35□□□□□ -0.59
ATRQ13535 AC009163.3-201ENST00000563554 852 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
ATRQ13535 AP001462.1-201ENST00000594089 452 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
ATRQ13535 GGNBP1-204ENST00000613113 887 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
ATRQ13535 LINC00969-294ENST00000627609 992 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
ATRQ13535 AC245369.7-201ENST00000631386 350 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
ATRQ13535 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ATRQ13535 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
ATRQ13535 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
ATRQ13535 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ATRQ13535 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ATRQ13535 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ATRQ13535 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ATRQ13535 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
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