Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 ATXN2L-205ENST00000395547 3981 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CBX3Q13185 FAM120C-202ENST00000375180 8057 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CBX3Q13185 IP6K1-202ENST00000395238 4117 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CBX3Q13185 CRY2-212ENST00000616623 4204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CBX3Q13185 WASHC2A-209ENST00000611324 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CBX3Q13185 SIAE-201ENST00000263593 5583 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CBX3Q13185 WDFY1-201ENST00000233055 4660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CBX3Q13185 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CBX3Q13185 NLRP2-201ENST00000263437 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CBX3Q13185 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CBX3Q13185 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CBX3Q13185 ADAT1-201ENST00000307921 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CBX3Q13185 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CBX3Q13185 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CBX3Q13185 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CBX3Q13185 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CBX3Q13185 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CBX3Q13185 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CBX3Q13185 CDC20B-203ENST00000381375 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CBX3Q13185 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CBX3Q13185 PPP2R1B-204ENST00000426998 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CBX3Q13185 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CBX3Q13185 AL391845.2-201ENST00000443930 1954 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CBX3Q13185 ALDH1L1-205ENST00000452905 2758 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CBX3Q13185 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CBX3Q13185 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CBX3Q13185 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
CBX3Q13185 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CBX3Q13185 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CBX3Q13185 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CBX3Q13185 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CBX3Q13185 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CBX3Q13185 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CBX3Q13185 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
CBX3Q13185 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CBX3Q13185 IL12RB1-203ENST00000593993 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CBX3Q13185 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CBX3Q13185 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
CBX3Q13185 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CBX3Q13185 RXRG-204ENST00000619224 2252 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CBX3Q13185 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CBX3Q13185 AL590644.1-201ENST00000412427 4676 ntTSL 4 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CBX3Q13185 PTK2-202ENST00000395218 4415 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CBX3Q13185 SNED1-205ENST00000405547 7986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CBX3Q13185 UBP1-204ENST00000447368 3669 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CBX3Q13185 CSF2RB-203ENST00000406230 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CBX3Q13185 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CBX3Q13185 EPM2A-207ENST00000611340 2786 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CBX3Q13185 CACNA1G-214ENST00000505165 6633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CBX3Q13185 ESYT1-202ENST00000394048 4388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CBX3Q13185 CYP26B1-205ENST00000546307 4331 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CBX3Q13185 DDC-207ENST00000444124 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CBX3Q13185 LENG8-201ENST00000326764 3991 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CBX3Q13185 ABLIM2-215ENST00000545242 1972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CBX3Q13185 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CBX3Q13185 KCNC2-201ENST00000298972 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CBX3Q13185 P3H2-201ENST00000319332 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CBX3Q13185 PNPO-217ENST00000642017 3465 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CBX3Q13185 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CBX3Q13185 SMARCA4-204ENST00000444061 4938 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CBX3Q13185 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CBX3Q13185 DAAM2-202ENST00000398904 6224 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CBX3Q13185 PARN-203ENST00000437198 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CBX3Q13185 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CBX3Q13185 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CBX3Q13185 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CBX3Q13185 PSAP-201ENST00000394934 2830 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CBX3Q13185 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CBX3Q13185 BDKRB2-202ENST00000542454 6845 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CBX3Q13185 MAGED1-201ENST00000326587 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CBX3Q13185 WNT9A-201ENST00000272164 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CBX3Q13185 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CBX3Q13185 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CBX3Q13185 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CBX3Q13185 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
CBX3Q13185 PIWIL1-201ENST00000245255 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CBX3Q13185 PTGR2-205ENST00000555661 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CBX3Q13185 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CBX3Q13185 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CBX3Q13185 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CBX3Q13185 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
CBX3Q13185 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CBX3Q13185 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
CBX3Q13185 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CBX3Q13185 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CBX3Q13185 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CBX3Q13185 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CBX3Q13185 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CBX3Q13185 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CBX3Q13185 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CBX3Q13185 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CBX3Q13185 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CBX3Q13185 STK11IP-204ENST00000456909 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CBX3Q13185 CYP26B1-201ENST00000001146 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CBX3Q13185 DHX38-201ENST00000268482 4608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CBX3Q13185 CALCOCO1-218ENST00000550804 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CBX3Q13185 DNAH2-202ENST00000570791 2994 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CBX3Q13185 NPHP3-ACAD11-201ENST00000471702 7784 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CBX3Q13185 DYNC1I1-202ENST00000359388 2843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CBX3Q13185 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
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