Protein–RNA interactions for Protein: Q13033

STRN3, Striatin-3, humanhuman

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Length 797 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRN3Q13033 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
STRN3Q13033 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
STRN3Q13033 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
STRN3Q13033 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
STRN3Q13033 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
STRN3Q13033 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
STRN3Q13033 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
STRN3Q13033 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
STRN3Q13033 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
STRN3Q13033 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
STRN3Q13033 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
STRN3Q13033 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
STRN3Q13033 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
STRN3Q13033 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
STRN3Q13033 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
STRN3Q13033 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
STRN3Q13033 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
STRN3Q13033 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
STRN3Q13033 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
STRN3Q13033 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
STRN3Q13033 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
STRN3Q13033 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
STRN3Q13033 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
STRN3Q13033 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
STRN3Q13033 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
STRN3Q13033 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
STRN3Q13033 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
STRN3Q13033 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
STRN3Q13033 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
STRN3Q13033 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
STRN3Q13033 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
STRN3Q13033 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
STRN3Q13033 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
STRN3Q13033 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
STRN3Q13033 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
STRN3Q13033 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
STRN3Q13033 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
STRN3Q13033 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
STRN3Q13033 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
STRN3Q13033 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
STRN3Q13033 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
STRN3Q13033 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
STRN3Q13033 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
STRN3Q13033 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
STRN3Q13033 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
STRN3Q13033 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
STRN3Q13033 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
STRN3Q13033 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
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STRN3Q13033 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
STRN3Q13033 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
STRN3Q13033 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
STRN3Q13033 EPAS1-201ENST00000263734 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
STRN3Q13033 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
STRN3Q13033 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
STRN3Q13033 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
STRN3Q13033 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
STRN3Q13033 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
STRN3Q13033 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
STRN3Q13033 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
STRN3Q13033 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
STRN3Q13033 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
STRN3Q13033 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
STRN3Q13033 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
STRN3Q13033 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
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STRN3Q13033 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
STRN3Q13033 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
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STRN3Q13033 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
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STRN3Q13033 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
STRN3Q13033 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
STRN3Q13033 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
STRN3Q13033 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
STRN3Q13033 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
STRN3Q13033 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
STRN3Q13033 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
STRN3Q13033 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
STRN3Q13033 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
STRN3Q13033 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
STRN3Q13033 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
STRN3Q13033 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
STRN3Q13033 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
STRN3Q13033 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
STRN3Q13033 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
STRN3Q13033 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
STRN3Q13033 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
STRN3Q13033 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
STRN3Q13033 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
STRN3Q13033 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
STRN3Q13033 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
STRN3Q13033 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
STRN3Q13033 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
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