Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
FOXD4Q12950 MARVELD2-201ENST00000325631 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
FOXD4Q12950 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
FOXD4Q12950 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
FOXD4Q12950 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
FOXD4Q12950 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
FOXD4Q12950 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
FOXD4Q12950 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
FOXD4Q12950 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
FOXD4Q12950 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
FOXD4Q12950 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
FOXD4Q12950 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
FOXD4Q12950 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
FOXD4Q12950 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
FOXD4Q12950 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
FOXD4Q12950 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC14.18□□□□□ -0.14
FOXD4Q12950 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
FOXD4Q12950 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
FOXD4Q12950 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
FOXD4Q12950 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
FOXD4Q12950 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
FOXD4Q12950 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
FOXD4Q12950 AC026790.1-201ENST00000399760 2941 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
FOXD4Q12950 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
FOXD4Q12950 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
FOXD4Q12950 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
FOXD4Q12950 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
FOXD4Q12950 RTL10-202ENST00000405640 6785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
FOXD4Q12950 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
FOXD4Q12950 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
FOXD4Q12950 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
FOXD4Q12950 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
FOXD4Q12950 DNMT3B-202ENST00000328111 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
FOXD4Q12950 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
FOXD4Q12950 TCAF2-202ENST00000411935 2906 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
FOXD4Q12950 MAP4K2-201ENST00000294066 7178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
FOXD4Q12950 TOLLIP-202ENST00000317204 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
FOXD4Q12950 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
FOXD4Q12950 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
FOXD4Q12950 SRGAP3-201ENST00000360413 8415 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
FOXD4Q12950 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
FOXD4Q12950 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
FOXD4Q12950 NLRX1-201ENST00000292199 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
FOXD4Q12950 ANKRD36-204ENST00000461153 6102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
FOXD4Q12950 SELPLG-203ENST00000550948 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
FOXD4Q12950 SP6-202ENST00000536300 3848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
FOXD4Q12950 ZFYVE28-211ENST00000515312 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
FOXD4Q12950 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
FOXD4Q12950 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
FOXD4Q12950 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
FOXD4Q12950 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
FOXD4Q12950 ASH2L-201ENST00000343823 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
FOXD4Q12950 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
FOXD4Q12950 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
FOXD4Q12950 EIF2AK1-201ENST00000199389 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
FOXD4Q12950 AC022384.1-202ENST00000450534 2831 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
FOXD4Q12950 PASK-201ENST00000234040 4572 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
FOXD4Q12950 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
FOXD4Q12950 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
FOXD4Q12950 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
FOXD4Q12950 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
FOXD4Q12950 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
FOXD4Q12950 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
FOXD4Q12950 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
FOXD4Q12950 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
FOXD4Q12950 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
FOXD4Q12950 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
FOXD4Q12950 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
FOXD4Q12950 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
FOXD4Q12950 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
FOXD4Q12950 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
FOXD4Q12950 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
FOXD4Q12950 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
FOXD4Q12950 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
FOXD4Q12950 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
FOXD4Q12950 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
FOXD4Q12950 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
FOXD4Q12950 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
FOXD4Q12950 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
FOXD4Q12950 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
FOXD4Q12950 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
FOXD4Q12950 EIF3A-201ENST00000369144 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
FOXD4Q12950 EPRS-201ENST00000366923 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
FOXD4Q12950 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
FOXD4Q12950 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
FOXD4Q12950 TLE1-203ENST00000376499 3893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
FOXD4Q12950 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
FOXD4Q12950 PELP1-202ENST00000436683 3524 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
FOXD4Q12950 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
FOXD4Q12950 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
FOXD4Q12950 CELSR3-201ENST00000164024 11956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
FOXD4Q12950 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
FOXD4Q12950 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
FOXD4Q12950 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
FOXD4Q12950 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
FOXD4Q12950 XPO7-201ENST00000252512 4861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
FOXD4Q12950 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
FOXD4Q12950 AC141928.1-201ENST00000511928 4525 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
FOXD4Q12950 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
FOXD4Q12950 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms