Protein–RNA interactions for Protein: Q12946

FOXF1, Forkhead box protein F1, humanhuman

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Length 379 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF1Q12946 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
FOXF1Q12946 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
FOXF1Q12946 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
FOXF1Q12946 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
FOXF1Q12946 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
FOXF1Q12946 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
FOXF1Q12946 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
FOXF1Q12946 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
FOXF1Q12946 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
FOXF1Q12946 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
FOXF1Q12946 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
FOXF1Q12946 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
FOXF1Q12946 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
FOXF1Q12946 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
FOXF1Q12946 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
FOXF1Q12946 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
FOXF1Q12946 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
FOXF1Q12946 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
FOXF1Q12946 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
FOXF1Q12946 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
FOXF1Q12946 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
FOXF1Q12946 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
FOXF1Q12946 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
FOXF1Q12946 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
FOXF1Q12946 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
FOXF1Q12946 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
FOXF1Q12946 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
FOXF1Q12946 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
FOXF1Q12946 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
FOXF1Q12946 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
FOXF1Q12946 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
FOXF1Q12946 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
FOXF1Q12946 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
FOXF1Q12946 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
FOXF1Q12946 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
FOXF1Q12946 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
FOXF1Q12946 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC13.34□□□□□ -0.27
FOXF1Q12946 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
FOXF1Q12946 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
FOXF1Q12946 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
FOXF1Q12946 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
FOXF1Q12946 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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FOXF1Q12946 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
FOXF1Q12946 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
FOXF1Q12946 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
FOXF1Q12946 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
FOXF1Q12946 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
FOXF1Q12946 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
FOXF1Q12946 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
FOXF1Q12946 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
FOXF1Q12946 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
FOXF1Q12946 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
FOXF1Q12946 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
FOXF1Q12946 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
FOXF1Q12946 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
FOXF1Q12946 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
FOXF1Q12946 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
FOXF1Q12946 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
FOXF1Q12946 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
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FOXF1Q12946 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
FOXF1Q12946 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.33□□□□□ -0.27
FOXF1Q12946 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
FOXF1Q12946 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.27
FOXF1Q12946 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.27
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FOXF1Q12946 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
FOXF1Q12946 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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FOXF1Q12946 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
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FOXF1Q12946 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
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FOXF1Q12946 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
FOXF1Q12946 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
FOXF1Q12946 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
FOXF1Q12946 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
FOXF1Q12946 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
FOXF1Q12946 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
FOXF1Q12946 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
FOXF1Q12946 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
FOXF1Q12946 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
FOXF1Q12946 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
FOXF1Q12946 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC13.33□□□□□ -0.28
FOXF1Q12946 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
FOXF1Q12946 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
FOXF1Q12946 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
FOXF1Q12946 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC13.33□□□□□ -0.28
FOXF1Q12946 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
FOXF1Q12946 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
FOXF1Q12946 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
FOXF1Q12946 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
FOXF1Q12946 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
FOXF1Q12946 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
FOXF1Q12946 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
FOXF1Q12946 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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