Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

Predictions only

Length 1,337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPRJQ12913 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPRJQ12913 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPRJQ12913 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPRJQ12913 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPRJQ12913 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPRJQ12913 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPRJQ12913 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPRJQ12913 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPRJQ12913 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPRJQ12913 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPRJQ12913 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPRJQ12913 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPRJQ12913 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPRJQ12913 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPRJQ12913 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPRJQ12913 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPRJQ12913 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPRJQ12913 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPRJQ12913 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPRJQ12913 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPRJQ12913 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPRJQ12913 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPRJQ12913 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPRJQ12913 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPRJQ12913 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPRJQ12913 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPRJQ12913 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPRJQ12913 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPRJQ12913 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPRJQ12913 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPRJQ12913 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPRJQ12913 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPRJQ12913 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPRJQ12913 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPRJQ12913 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPRJQ12913 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPRJQ12913 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPRJQ12913 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPRJQ12913 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPRJQ12913 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPRJQ12913 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPRJQ12913 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPRJQ12913 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPRJQ12913 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPRJQ12913 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPRJQ12913 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPRJQ12913 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPRJQ12913 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPRJQ12913 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPRJQ12913 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPRJQ12913 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPRJQ12913 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPRJQ12913 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPRJQ12913 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPRJQ12913 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPRJQ12913 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPRJQ12913 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPRJQ12913 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPRJQ12913 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPRJQ12913 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPRJQ12913 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPRJQ12913 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPRJQ12913 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPRJQ12913 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPRJQ12913 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPRJQ12913 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPRJQ12913 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPRJQ12913 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPRJQ12913 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPRJQ12913 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPRJQ12913 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPRJQ12913 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPRJQ12913 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPRJQ12913 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPRJQ12913 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPRJQ12913 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPRJQ12913 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPRJQ12913 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPRJQ12913 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPRJQ12913 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPRJQ12913 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPRJQ12913 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPRJQ12913 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPRJQ12913 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPRJQ12913 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPRJQ12913 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPRJQ12913 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPRJQ12913 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPRJQ12913 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPRJQ12913 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPRJQ12913 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPRJQ12913 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPRJQ12913 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPRJQ12913 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPRJQ12913 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPRJQ12913 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPRJQ12913 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPRJQ12913 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPRJQ12913 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 176 ms