Protein–RNA interactions for Protein: Q0VFZ6

CCDC173, Coiled-coil domain-containing protein 173, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC173Q0VFZ6 STK25-235ENST00000543554 2556 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC173Q0VFZ6 AOC1-204ENST00000467291 2857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC173Q0VFZ6 MLPH-201ENST00000264605 3823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC173Q0VFZ6 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC173Q0VFZ6 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC173Q0VFZ6 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC173Q0VFZ6 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC173Q0VFZ6 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC173Q0VFZ6 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC173Q0VFZ6 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC173Q0VFZ6 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC173Q0VFZ6 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC173Q0VFZ6 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC173Q0VFZ6 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC173Q0VFZ6 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC173Q0VFZ6 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC173Q0VFZ6 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC173Q0VFZ6 ABI2-213ENST00000424558 2240 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC173Q0VFZ6 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC173Q0VFZ6 BHLHE40-AS1-204ENST00000620618 2355 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC173Q0VFZ6 PSMC1-201ENST00000261303 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC173Q0VFZ6 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC173Q0VFZ6 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC173Q0VFZ6 PIK3R3-203ENST00000420542 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC173Q0VFZ6 WNK1-201ENST00000315939 10452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC173Q0VFZ6 ELN-222ENST00000458204 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC173Q0VFZ6 AC239799.1-201ENST00000612520 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC173Q0VFZ6 CRISPLD2-209ENST00000567845 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC173Q0VFZ6 COPS7B-223ENST00000611614 2468 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC173Q0VFZ6 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC173Q0VFZ6 COASY-211ENST00000590958 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC173Q0VFZ6 AL031719.1-201ENST00000623365 2587 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC173Q0VFZ6 ASB2-201ENST00000315988 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC173Q0VFZ6 PTK7-203ENST00000345201 4071 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC173Q0VFZ6 GTF2IRD2B-203ENST00000472837 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC173Q0VFZ6 GPA33-201ENST00000367868 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC173Q0VFZ6 ZBTB20-206ENST00000464560 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC173Q0VFZ6 MYRIP-204ENST00000444716 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC173Q0VFZ6 GOLGA2P5-201ENST00000266746 2395 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC173Q0VFZ6 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC173Q0VFZ6 HSP90AA1-201ENST00000216281 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC173Q0VFZ6 MKLN1-203ENST00000421797 2460 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC173Q0VFZ6 AL445209.1-201ENST00000607269 3491 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC173Q0VFZ6 BTRC-203ENST00000393441 6084 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC173Q0VFZ6 GRM1-203ENST00000361719 6754 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC173Q0VFZ6 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC173Q0VFZ6 LARP4-201ENST00000293618 6296 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC173Q0VFZ6 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC173Q0VFZ6 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC173Q0VFZ6 MBP-208ENST00000397866 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC173Q0VFZ6 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC173Q0VFZ6 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC173Q0VFZ6 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC173Q0VFZ6 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC173Q0VFZ6 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC173Q0VFZ6 GPRC5B-209ENST00000569479 2984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC173Q0VFZ6 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC173Q0VFZ6 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC173Q0VFZ6 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC173Q0VFZ6 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC173Q0VFZ6 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC173Q0VFZ6 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC173Q0VFZ6 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC173Q0VFZ6 ZNF829-201ENST00000391711 1805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC173Q0VFZ6 DHTKD1-201ENST00000263035 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC173Q0VFZ6 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC173Q0VFZ6 LCOR-203ENST00000371097 4852 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC173Q0VFZ6 TNPO2-218ENST00000592287 2914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC173Q0VFZ6 AC125611.4-201ENST00000553259 4166 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC173Q0VFZ6 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC173Q0VFZ6 MTSS1-201ENST00000325064 2777 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC173Q0VFZ6 C5orf56-206ENST00000612967 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC173Q0VFZ6 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC173Q0VFZ6 ROPN1-206ENST00000479867 2056 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC173Q0VFZ6 AOC1-201ENST00000360937 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC173Q0VFZ6 AC244197.3-201ENST00000422081 2635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC173Q0VFZ6 GNPDA1-204ENST00000503794 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC173Q0VFZ6 NUB1-201ENST00000413040 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC173Q0VFZ6 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC173Q0VFZ6 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC173Q0VFZ6 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC173Q0VFZ6 RIOK3-203ENST00000577501 1904 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC173Q0VFZ6 PAM-207ENST00000455264 2898 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC173Q0VFZ6 TNS2-202ENST00000314276 4944 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC173Q0VFZ6 DAB2IP-202ENST00000309989 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC173Q0VFZ6 NAP1L2-201ENST00000373517 2550 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC173Q0VFZ6 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC173Q0VFZ6 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC173Q0VFZ6 AC106818.1-201ENST00000623223 3242 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC173Q0VFZ6 ZNF778-202ENST00000433976 3608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC173Q0VFZ6 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC173Q0VFZ6 ADPRHL1-204ENST00000612156 9759 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC173Q0VFZ6 NADK-202ENST00000341991 3098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC173Q0VFZ6 PLEKHG2-206ENST00000458508 3898 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC173Q0VFZ6 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC173Q0VFZ6 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC173Q0VFZ6 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC173Q0VFZ6 INSC-207ENST00000528567 2237 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC173Q0VFZ6 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC173Q0VFZ6 SYNPO-205ENST00000522122 5098 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 412.9 ms