Protein–RNA interactions for Protein: Q00994

BEX3, Protein BEX3, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEX3Q00994 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BEX3Q00994 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BEX3Q00994 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BEX3Q00994 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
BEX3Q00994 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BEX3Q00994 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
BEX3Q00994 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
BEX3Q00994 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BEX3Q00994 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
BEX3Q00994 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BEX3Q00994 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
BEX3Q00994 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
BEX3Q00994 SLC35B2-206ENST00000615337 2014 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BEX3Q00994 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BEX3Q00994 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BEX3Q00994 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BEX3Q00994 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BEX3Q00994 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BEX3Q00994 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BEX3Q00994 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BEX3Q00994 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BEX3Q00994 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BEX3Q00994 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BEX3Q00994 INS-IGF2-202ENST00000397270 828 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BEX3Q00994 AL357563.1-201ENST00000404728 395 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
BEX3Q00994 AC093627.2-201ENST00000497017 568 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BEX3Q00994 AC026410.1-201ENST00000507366 1101 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
BEX3Q00994 LINC02062-201ENST00000513175 478 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BEX3Q00994 RNA5SP417-201ENST00000516459 108 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
BEX3Q00994 FXYD2-205ENST00000528014 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BEX3Q00994 AC012379.2-201ENST00000560237 765 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BEX3Q00994 AC141586.1-203ENST00000567242 366 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
BEX3Q00994 MAFTRR-203ENST00000567993 685 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BEX3Q00994 SLC27A5-204ENST00000594786 643 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BEX3Q00994 LINC00431-202ENST00000636375 159 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
BEX3Q00994 VAMP2-202ENST00000404970 1479 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BEX3Q00994 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BEX3Q00994 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BEX3Q00994 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BEX3Q00994 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BEX3Q00994 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BEX3Q00994 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BEX3Q00994 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BEX3Q00994 CNBP-201ENST00000422453 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BEX3Q00994 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BEX3Q00994 FAM69C-202ENST00000400291 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BEX3Q00994 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BEX3Q00994 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BEX3Q00994 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BEX3Q00994 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BEX3Q00994 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BEX3Q00994 SLC44A3-209ENST00000532427 1912 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BEX3Q00994 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BEX3Q00994 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BEX3Q00994 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BEX3Q00994 EDNRB-204ENST00000626030 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BEX3Q00994 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BEX3Q00994 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BEX3Q00994 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BEX3Q00994 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BEX3Q00994 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BEX3Q00994 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BEX3Q00994 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BEX3Q00994 BRD7P5-201ENST00000299197 1822 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
BEX3Q00994 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BEX3Q00994 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BEX3Q00994 C8G-201ENST00000224181 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BEX3Q00994 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BEX3Q00994 C7orf61-201ENST00000332375 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BEX3Q00994 ASNA1-201ENST00000357332 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BEX3Q00994 MAGOH-202ENST00000371470 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BEX3Q00994 GUSBP10-201ENST00000417412 665 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
BEX3Q00994 AC092265.1-201ENST00000422638 498 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BEX3Q00994 IZUMO1R-202ENST00000440961 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BEX3Q00994 AC092638.2-201ENST00000441105 947 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
BEX3Q00994 TAC3-208ENST00000441881 731 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BEX3Q00994 RPL18AP8-201ENST00000486071 528 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
BEX3Q00994 AC037486.1-201ENST00000523792 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BEX3Q00994 NACA-221ENST00000552540 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BEX3Q00994 AL355916.2-201ENST00000556543 593 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BEX3Q00994 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
BEX3Q00994 AC145207.8-201ENST00000580897 563 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BEX3Q00994 SNHG25-202ENST00000582965 278 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BEX3Q00994 TAC3-211ENST00000615887 1120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BEX3Q00994 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BEX3Q00994 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BEX3Q00994 METAP2-205ENST00000546753 1862 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BEX3Q00994 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BEX3Q00994 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BEX3Q00994 AC011287.1-201ENST00000639998 1349 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BEX3Q00994 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BEX3Q00994 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BEX3Q00994 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BEX3Q00994 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BEX3Q00994 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BEX3Q00994 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BEX3Q00994 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BEX3Q00994 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
BEX3Q00994 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BEX3Q00994 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms