Protein–RNA interactions for Protein: Q00403

GTF2B, Transcription initiation factor IIB, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2BQ00403 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GTF2BQ00403 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GTF2BQ00403 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GTF2BQ00403 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GTF2BQ00403 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GTF2BQ00403 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GTF2BQ00403 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GTF2BQ00403 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GTF2BQ00403 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GTF2BQ00403 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GTF2BQ00403 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GTF2BQ00403 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GTF2BQ00403 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GTF2BQ00403 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GTF2BQ00403 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GTF2BQ00403 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
GTF2BQ00403 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GTF2BQ00403 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GTF2BQ00403 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GTF2BQ00403 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GTF2BQ00403 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GTF2BQ00403 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GTF2BQ00403 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GTF2BQ00403 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GTF2BQ00403 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GTF2BQ00403 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GTF2BQ00403 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GTF2BQ00403 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
GTF2BQ00403 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
GTF2BQ00403 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GTF2BQ00403 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GTF2BQ00403 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GTF2BQ00403 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GTF2BQ00403 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GTF2BQ00403 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GTF2BQ00403 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GTF2BQ00403 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GTF2BQ00403 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GTF2BQ00403 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GTF2BQ00403 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GTF2BQ00403 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GTF2BQ00403 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GTF2BQ00403 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GTF2BQ00403 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GTF2BQ00403 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GTF2BQ00403 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GTF2BQ00403 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GTF2BQ00403 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GTF2BQ00403 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GTF2BQ00403 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GTF2BQ00403 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GTF2BQ00403 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GTF2BQ00403 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GTF2BQ00403 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GTF2BQ00403 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GTF2BQ00403 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GTF2BQ00403 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GTF2BQ00403 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GTF2BQ00403 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GTF2BQ00403 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
GTF2BQ00403 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
GTF2BQ00403 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GTF2BQ00403 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
GTF2BQ00403 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GTF2BQ00403 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GTF2BQ00403 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GTF2BQ00403 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GTF2BQ00403 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GTF2BQ00403 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GTF2BQ00403 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GTF2BQ00403 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GTF2BQ00403 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GTF2BQ00403 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GTF2BQ00403 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GTF2BQ00403 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GTF2BQ00403 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GTF2BQ00403 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GTF2BQ00403 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GTF2BQ00403 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
GTF2BQ00403 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
GTF2BQ00403 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
GTF2BQ00403 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
GTF2BQ00403 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
GTF2BQ00403 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GTF2BQ00403 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GTF2BQ00403 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
GTF2BQ00403 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GTF2BQ00403 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GTF2BQ00403 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GTF2BQ00403 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GTF2BQ00403 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GTF2BQ00403 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GTF2BQ00403 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GTF2BQ00403 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GTF2BQ00403 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
GTF2BQ00403 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GTF2BQ00403 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GTF2BQ00403 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GTF2BQ00403 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GTF2BQ00403 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms