Protein–RNA interactions for Protein: P80217

IFI35, Interferon-induced 35 kDa protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFI35P80217 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFI35P80217 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFI35P80217 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFI35P80217 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFI35P80217 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFI35P80217 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFI35P80217 SLC23A1-201ENST00000348729 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFI35P80217 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFI35P80217 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
IFI35P80217 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFI35P80217 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFI35P80217 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFI35P80217 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFI35P80217 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFI35P80217 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFI35P80217 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFI35P80217 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFI35P80217 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
IFI35P80217 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFI35P80217 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFI35P80217 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
IFI35P80217 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFI35P80217 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFI35P80217 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFI35P80217 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFI35P80217 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
IFI35P80217 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFI35P80217 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
IFI35P80217 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFI35P80217 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFI35P80217 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFI35P80217 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFI35P80217 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFI35P80217 ZNF785-201ENST00000395216 3282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFI35P80217 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFI35P80217 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFI35P80217 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFI35P80217 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
IFI35P80217 MAP2K7-203ENST00000397983 3396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFI35P80217 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFI35P80217 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFI35P80217 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFI35P80217 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFI35P80217 ARFGAP1-212ENST00000519604 3191 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFI35P80217 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFI35P80217 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFI35P80217 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFI35P80217 PIP5K1B-208ENST00000541509 2664 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFI35P80217 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFI35P80217 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFI35P80217 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFI35P80217 PDE8A-201ENST00000310298 3984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFI35P80217 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFI35P80217 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFI35P80217 CDK20-201ENST00000325303 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFI35P80217 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFI35P80217 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFI35P80217 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFI35P80217 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFI35P80217 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFI35P80217 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFI35P80217 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFI35P80217 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFI35P80217 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFI35P80217 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFI35P80217 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFI35P80217 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFI35P80217 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFI35P80217 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFI35P80217 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFI35P80217 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFI35P80217 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
IFI35P80217 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFI35P80217 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFI35P80217 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFI35P80217 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFI35P80217 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFI35P80217 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFI35P80217 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFI35P80217 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFI35P80217 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFI35P80217 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
IFI35P80217 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
IFI35P80217 MFSD2B-201ENST00000338315 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFI35P80217 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFI35P80217 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFI35P80217 AC005562.1-201ENST00000583030 3219 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
IFI35P80217 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFI35P80217 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFI35P80217 B3GNT4-202ENST00000535274 2938 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFI35P80217 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFI35P80217 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFI35P80217 FXR1-214ENST00000480918 1996 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFI35P80217 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFI35P80217 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFI35P80217 PCDH8-201ENST00000338862 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFI35P80217 HBP1-212ENST00000485846 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFI35P80217 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFI35P80217 SAMD4B-201ENST00000314471 4519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFI35P80217 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms