Protein–RNA interactions for Protein: P38570

ITGAE, Integrin alpha-E, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAEP38570 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ITGAEP38570 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ITGAEP38570 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ITGAEP38570 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ITGAEP38570 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ITGAEP38570 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ITGAEP38570 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ITGAEP38570 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ITGAEP38570 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ITGAEP38570 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ITGAEP38570 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ITGAEP38570 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ITGAEP38570 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ITGAEP38570 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ITGAEP38570 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ITGAEP38570 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ITGAEP38570 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ITGAEP38570 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ITGAEP38570 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ITGAEP38570 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ITGAEP38570 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ITGAEP38570 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ITGAEP38570 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ITGAEP38570 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ITGAEP38570 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ITGAEP38570 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ITGAEP38570 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ITGAEP38570 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ITGAEP38570 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ITGAEP38570 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ITGAEP38570 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ITGAEP38570 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ITGAEP38570 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ITGAEP38570 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ITGAEP38570 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ITGAEP38570 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ITGAEP38570 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ITGAEP38570 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ITGAEP38570 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ITGAEP38570 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ITGAEP38570 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ITGAEP38570 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ITGAEP38570 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ITGAEP38570 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ITGAEP38570 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ITGAEP38570 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ITGAEP38570 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ITGAEP38570 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ITGAEP38570 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ITGAEP38570 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ITGAEP38570 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ITGAEP38570 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ITGAEP38570 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ITGAEP38570 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ITGAEP38570 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ITGAEP38570 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ITGAEP38570 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ITGAEP38570 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ITGAEP38570 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ITGAEP38570 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ITGAEP38570 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ITGAEP38570 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
ITGAEP38570 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
ITGAEP38570 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
ITGAEP38570 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ITGAEP38570 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ITGAEP38570 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
ITGAEP38570 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ITGAEP38570 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ITGAEP38570 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
ITGAEP38570 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ITGAEP38570 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ITGAEP38570 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ITGAEP38570 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ITGAEP38570 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ITGAEP38570 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ITGAEP38570 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ITGAEP38570 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ITGAEP38570 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ITGAEP38570 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ITGAEP38570 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ITGAEP38570 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ITGAEP38570 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ITGAEP38570 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ITGAEP38570 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
ITGAEP38570 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ITGAEP38570 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ITGAEP38570 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ITGAEP38570 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ITGAEP38570 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ITGAEP38570 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ITGAEP38570 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
ITGAEP38570 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
ITGAEP38570 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
ITGAEP38570 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
ITGAEP38570 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ITGAEP38570 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ITGAEP38570 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ITGAEP38570 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ITGAEP38570 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms