Protein–RNA interactions for Protein: P31415

CASQ1, Calsequestrin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1P31415 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CASQ1P31415 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CASQ1P31415 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CASQ1P31415 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CASQ1P31415 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CASQ1P31415 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CASQ1P31415 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CASQ1P31415 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CASQ1P31415 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CASQ1P31415 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CASQ1P31415 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CASQ1P31415 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CASQ1P31415 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CASQ1P31415 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CASQ1P31415 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CASQ1P31415 SGTB-201ENST00000381007 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CASQ1P31415 TICRR-201ENST00000268138 6775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CASQ1P31415 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CASQ1P31415 WWTR1-203ENST00000465804 5030 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CASQ1P31415 TCOF1-207ENST00000504761 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CASQ1P31415 TRAPPC10-201ENST00000291574 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CASQ1P31415 PFKP-203ENST00000381125 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CASQ1P31415 NRXN1-207ENST00000404971 7578 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CASQ1P31415 ZYG11A-201ENST00000371528 4469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CASQ1P31415 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CASQ1P31415 MDM1-203ENST00000393543 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CASQ1P31415 CSF2RB-202ENST00000403662 4863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CASQ1P31415 FASN-206ENST00000634990 8407 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CASQ1P31415 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CASQ1P31415 OAS3-201ENST00000228928 6719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CASQ1P31415 OSBPL2-201ENST00000313733 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CASQ1P31415 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CASQ1P31415 MYO16-202ENST00000356711 6874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CASQ1P31415 NCOA7-203ENST00000392477 6457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CASQ1P31415 GPR84-202ENST00000551809 2041 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CASQ1P31415 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CASQ1P31415 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CASQ1P31415 EPHA5-203ENST00000432638 3662 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CASQ1P31415 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CASQ1P31415 CD276-202ENST00000318443 3469 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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CASQ1P31415 TMEM123-201ENST00000361236 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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CASQ1P31415 CCDC126-202ENST00000409765 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CASQ1P31415 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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CASQ1P31415 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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CASQ1P31415 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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CASQ1P31415 ZC3H18-201ENST00000301011 3729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CASQ1P31415 MMP14-201ENST00000311852 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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CASQ1P31415 TBC1D3-201ENST00000620215 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CASQ1P31415 TBC1D3C-201ENST00000622206 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CASQ1P31415 FHOD3-206ENST00000590592 4869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CASQ1P31415 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CASQ1P31415 DLX1-203ENST00000361725 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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CASQ1P31415 METAP1D-201ENST00000315796 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CASQ1P31415 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CASQ1P31415 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CASQ1P31415 EPAS1-201ENST00000263734 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CASQ1P31415 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CASQ1P31415 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CASQ1P31415 POLD1-214ENST00000613923 3542 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CASQ1P31415 SLC4A8-205ENST00000535225 2262 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CASQ1P31415 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CASQ1P31415 GDPGP1-202ENST00000558017 5323 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CASQ1P31415 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CASQ1P31415 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CASQ1P31415 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CASQ1P31415 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CASQ1P31415 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CASQ1P31415 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CASQ1P31415 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CASQ1P31415 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CASQ1P31415 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CASQ1P31415 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CASQ1P31415 S100PBP-203ENST00000373476 3320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
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