Protein–RNA interactions for Protein: P01033

TIMP1, Metalloproteinase inhibitor 1, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMP1P01033 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TIMP1P01033 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TIMP1P01033 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TIMP1P01033 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TIMP1P01033 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TIMP1P01033 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TIMP1P01033 AC019109.1-201ENST00000401725 1874 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TIMP1P01033 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TIMP1P01033 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TIMP1P01033 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TIMP1P01033 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TIMP1P01033 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TIMP1P01033 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TIMP1P01033 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TIMP1P01033 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TIMP1P01033 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TIMP1P01033 OR52M2P-201ENST00000414298 959 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TIMP1P01033 SNX3-204ENST00000426155 1072 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TIMP1P01033 PRKAR2A-AS1-203ENST00000431705 592 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TIMP1P01033 NME6-208ENST00000435684 599 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TIMP1P01033 AC253536.3-201ENST00000444093 558 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TIMP1P01033 CD300LF-206ENST00000464910 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TIMP1P01033 RORA-AS1-201ENST00000501579 761 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TIMP1P01033 AC010285.2-201ENST00000510240 569 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TIMP1P01033 HTATIP2-205ENST00000530266 713 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TIMP1P01033 AP000866.5-201ENST00000531241 445 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TIMP1P01033 ANO3-205ENST00000531646 1264 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TIMP1P01033 ARL17B-203ENST00000570618 1140 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TIMP1P01033 MIR6816-201ENST00000620368 66 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TIMP1P01033 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TIMP1P01033 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TIMP1P01033 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TIMP1P01033 PSMG2-201ENST00000317615 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TIMP1P01033 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TIMP1P01033 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TIMP1P01033 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TIMP1P01033 RHOG-201ENST00000351018 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TIMP1P01033 SLC50A1-203ENST00000368404 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TIMP1P01033 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TIMP1P01033 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TIMP1P01033 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TIMP1P01033 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TIMP1P01033 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TIMP1P01033 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TIMP1P01033 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TIMP1P01033 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TIMP1P01033 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TIMP1P01033 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TIMP1P01033 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TIMP1P01033 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TIMP1P01033 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TIMP1P01033 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TIMP1P01033 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TIMP1P01033 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TIMP1P01033 ODCP-201ENST00000459650 1639 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
TIMP1P01033 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TIMP1P01033 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TIMP1P01033 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TIMP1P01033 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TIMP1P01033 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TIMP1P01033 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TIMP1P01033 GALP-201ENST00000357330 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TIMP1P01033 RNF144A-AS1-203ENST00000426122 579 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TIMP1P01033 AL157832.2-206ENST00000428178 601 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TIMP1P01033 GALP-202ENST00000440823 889 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TIMP1P01033 AL121796.1-201ENST00000505702 466 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TIMP1P01033 AC005740.1-201ENST00000515639 522 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TIMP1P01033 PAX5-210ENST00000520281 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TIMP1P01033 KRT18P37-201ENST00000520711 1282 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TIMP1P01033 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TIMP1P01033 SNRPF-204ENST00000552085 815 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TIMP1P01033 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TIMP1P01033 APOC1-209ENST00000592885 562 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TIMP1P01033 AC091769.1-201ENST00000619576 568 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TIMP1P01033 RARS2-201ENST00000369536 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TIMP1P01033 C12orf65-204ENST00000429587 1326 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TIMP1P01033 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TIMP1P01033 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TIMP1P01033 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TIMP1P01033 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TIMP1P01033 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TIMP1P01033 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TIMP1P01033 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TIMP1P01033 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TIMP1P01033 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TIMP1P01033 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TIMP1P01033 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TIMP1P01033 TMEM9-203ENST00000367333 1564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TIMP1P01033 ORC6-201ENST00000219097 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TIMP1P01033 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TIMP1P01033 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TIMP1P01033 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TIMP1P01033 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TIMP1P01033 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TIMP1P01033 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TIMP1P01033 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TIMP1P01033 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TIMP1P01033 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TIMP1P01033 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TIMP1P01033 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.2 ms