Protein–RNA interactions for Protein: J3QRK9

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QRK9 SMPDL3B-206ENST00000549094 1611 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
J3QRK9 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
J3QRK9 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
J3QRK9 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
J3QRK9 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
J3QRK9 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
J3QRK9 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
J3QRK9 DSE-201ENST00000331677 7237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
J3QRK9 FAM9C-205ENST00000542843 5858 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
J3QRK9 ALX4-201ENST00000329255 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
J3QRK9 SLC38A7-215ENST00000570101 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
J3QRK9 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
J3QRK9 NLRP2-202ENST00000339757 3422 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
J3QRK9 HECTD2-201ENST00000298068 4802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
J3QRK9 SLC37A4-202ENST00000357590 2356 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
J3QRK9 LPO-204ENST00000543544 2350 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
J3QRK9 ZNF410-201ENST00000324593 2293 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
J3QRK9 FUT3-207ENST00000589620 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
J3QRK9 ZSCAN16-AS1-201ENST00000600652 2163 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
J3QRK9 SIRT2-201ENST00000249396 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
J3QRK9 SIRT2-204ENST00000392081 2062 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
J3QRK9 KIF12-201ENST00000374118 2001 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
J3QRK9 LMAN2L-202ENST00000377079 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
J3QRK9 SVIL-AS1-204ENST00000427063 2025 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
J3QRK9 GRIP2-204ENST00000619221 7977 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
J3QRK9 LAMB2-201ENST00000305544 5643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
J3QRK9 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
J3QRK9 EPN2-202ENST00000347697 4664 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
J3QRK9 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
J3QRK9 ZMYM3-207ENST00000373998 6067 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
J3QRK9 MTMR3-204ENST00000401950 6018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
J3QRK9 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
J3QRK9 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
J3QRK9 GOLGA6L4-202ENST00000422563 4155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
J3QRK9 ANK1-205ENST00000347528 8237 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
J3QRK9 WNT9A-201ENST00000272164 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
J3QRK9 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
J3QRK9 ZNF799-202ENST00000430385 2583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
J3QRK9 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
J3QRK9 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
J3QRK9 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
J3QRK9 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC13.25□□□□□ -0.29
J3QRK9 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
J3QRK9 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
J3QRK9 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
J3QRK9 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
J3QRK9 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
J3QRK9 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
J3QRK9 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
J3QRK9 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
J3QRK9 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
J3QRK9 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
J3QRK9 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
J3QRK9 MICAL1-208ENST00000630715 3678 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
J3QRK9 SESN2-201ENST00000253063 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
J3QRK9 NOA1-201ENST00000264230 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
J3QRK9 CTBP1-AS2-206ENST00000581398 5652 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
J3QRK9 UAP1L1-201ENST00000360271 3201 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
J3QRK9 POMT1-203ENST00000372228 3123 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
J3QRK9 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
J3QRK9 NHEJ1-201ENST00000356853 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
J3QRK9 FMNL3-205ENST00000550488 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
J3QRK9 ZMIZ2-206ENST00000441627 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
J3QRK9 TKT-203ENST00000423525 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
J3QRK9 ADCYAP1R1-201ENST00000304166 6487 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
J3QRK9 INPP5J-208ENST00000412277 3512 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
J3QRK9 TRMT1L-201ENST00000367506 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
J3QRK9 PSKH1-201ENST00000291041 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
J3QRK9 HPX-201ENST00000265983 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
J3QRK9 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
J3QRK9 DUOXA1-205ENST00000558422 1678 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
J3QRK9 EDEM3-202ENST00000367512 6678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
J3QRK9 ABCC6-201ENST00000205557 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
J3QRK9 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
J3QRK9 OPN4-201ENST00000241891 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
J3QRK9 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
J3QRK9 PRR3-202ENST00000376560 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
J3QRK9 AP003969.2-201ENST00000623739 2275 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
J3QRK9 AC145098.2-201ENST00000623593 3026 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
J3QRK9 SFTPA1-202ENST00000419470 2210 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
J3QRK9 FAM90A11P-201ENST00000518378 2218 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
J3QRK9 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
J3QRK9 LYN-204ENST00000520220 5808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
J3QRK9 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
J3QRK9 STAT3-203ENST00000404395 2633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
J3QRK9 TBC1D8B-202ENST00000310452 2589 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
J3QRK9 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
J3QRK9 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
J3QRK9 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
J3QRK9 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
J3QRK9 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
J3QRK9 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
J3QRK9 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
J3QRK9 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
J3QRK9 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
J3QRK9 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC13.24□□□□□ -0.29
J3QRK9 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC13.24□□□□□ -0.29
J3QRK9 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
J3QRK9 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
J3QRK9 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms