Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

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Length 477 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ERVV-1B6SEH8 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ERVV-1B6SEH8 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ERVV-1B6SEH8 PON3-201ENST00000265627 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ERVV-1B6SEH8 BGLAP-201ENST00000368272 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ERVV-1B6SEH8 MAPK13-202ENST00000373759 1036 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ERVV-1B6SEH8 AL935212.1-201ENST00000377548 906 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ERVV-1B6SEH8 GEMIN7-202ENST00000391951 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ERVV-1B6SEH8 AC092265.1-201ENST00000422638 498 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ERVV-1B6SEH8 VEGFB-202ENST00000426086 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ERVV-1B6SEH8 LINC00028-201ENST00000435497 587 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ERVV-1B6SEH8 CSNK1G2P1-201ENST00000442675 955 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ERVV-1B6SEH8 AC006455.8-201ENST00000451381 351 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ERVV-1B6SEH8 LINC02435-201ENST00000508291 584 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ERVV-1B6SEH8 OR5BD1P-201ENST00000532527 817 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ERVV-1B6SEH8 CRTC3-AS1-202ENST00000559531 657 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ERVV-1B6SEH8 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ERVV-1B6SEH8 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ERVV-1B6SEH8 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ERVV-1B6SEH8 AC010096.1-201ENST00000443897 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ERVV-1B6SEH8 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ERVV-1B6SEH8 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ERVV-1B6SEH8 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ERVV-1B6SEH8 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ERVV-1B6SEH8 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ERVV-1B6SEH8 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ERVV-1B6SEH8 HPGD-209ENST00000510901 1535 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ERVV-1B6SEH8 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ERVV-1B6SEH8 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ERVV-1B6SEH8 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ERVV-1B6SEH8 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERVV-1B6SEH8 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERVV-1B6SEH8 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERVV-1B6SEH8 CCDC51-206ENST00000447018 1461 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERVV-1B6SEH8 ERCC1-208ENST00000589165 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERVV-1B6SEH8 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERVV-1B6SEH8 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERVV-1B6SEH8 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERVV-1B6SEH8 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERVV-1B6SEH8 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERVV-1B6SEH8 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERVV-1B6SEH8 VPS25-201ENST00000253794 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERVV-1B6SEH8 KRTAP2-2-201ENST00000398477 733 ntAPPRIS P2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERVV-1B6SEH8 ACTG2-204ENST00000409918 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERVV-1B6SEH8 LINC01868-201ENST00000414965 562 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERVV-1B6SEH8 AL606748.1-201ENST00000423919 655 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERVV-1B6SEH8 AL008733.1-201ENST00000440516 469 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERVV-1B6SEH8 AC011247.2-201ENST00000457097 233 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERVV-1B6SEH8 AC233724.6-201ENST00000503184 1088 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERVV-1B6SEH8 SNCB-203ENST00000506696 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERVV-1B6SEH8 AL355916.2-201ENST00000556543 593 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERVV-1B6SEH8 SPINT2-204ENST00000587090 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERVV-1B6SEH8 DHPS-207ENST00000594424 1172 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERVV-1B6SEH8 PGPEP1-203ENST00000595066 762 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERVV-1B6SEH8 IRF3-225ENST00000600022 882 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERVV-1B6SEH8 CEP128-201ENST00000216517 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERVV-1B6SEH8 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERVV-1B6SEH8 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERVV-1B6SEH8 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERVV-1B6SEH8 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERVV-1B6SEH8 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERVV-1B6SEH8 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ERVV-1B6SEH8 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERVV-1B6SEH8 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERVV-1B6SEH8 RBM4B-201ENST00000310046 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERVV-1B6SEH8 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERVV-1B6SEH8 AKR1C2-202ENST00000421196 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERVV-1B6SEH8 LINC01029-204ENST00000583106 1465 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERVV-1B6SEH8 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERVV-1B6SEH8 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERVV-1B6SEH8 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERVV-1B6SEH8 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERVV-1B6SEH8 AC067931.2-201ENST00000623655 2003 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ERVV-1B6SEH8 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERVV-1B6SEH8 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERVV-1B6SEH8 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERVV-1B6SEH8 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERVV-1B6SEH8 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERVV-1B6SEH8 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ERVV-1B6SEH8 CST5-201ENST00000304710 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERVV-1B6SEH8 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERVV-1B6SEH8 SAT1-201ENST00000379251 801 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERVV-1B6SEH8 SAT1-202ENST00000379253 909 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERVV-1B6SEH8 SAT1-203ENST00000379254 868 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERVV-1B6SEH8 SAT1-204ENST00000379270 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERVV-1B6SEH8 INS-IGF2-202ENST00000397270 828 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERVV-1B6SEH8 AC097059.1-201ENST00000413103 885 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERVV-1B6SEH8 AC006987.1-201ENST00000413610 527 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ERVV-1B6SEH8 NDUFS7-203ENST00000414651 841 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERVV-1B6SEH8 AC004837.1-201ENST00000446267 564 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ERVV-1B6SEH8 ASGR2-203ENST00000446679 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERVV-1B6SEH8 ZAP70-202ENST00000451498 1085 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERVV-1B6SEH8 AC108462.1-201ENST00000457467 850 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERVV-1B6SEH8 TRBC2-201ENST00000466254 758 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERVV-1B6SEH8 RPS23-204ENST00000507980 836 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERVV-1B6SEH8 AC068867.1-201ENST00000559855 150 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ERVV-1B6SEH8 AC012645.2-201ENST00000566190 553 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERVV-1B6SEH8 IGHV3OR16-12-201ENST00000570121 353 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERVV-1B6SEH8 UPF3AP2-202ENST00000578315 730 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERVV-1B6SEH8 AC138466.5-201ENST00000624002 808 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
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