Protein–RNA interactions for Protein: A6NNP5

CCDC169, Coiled-coil domain-containing protein 169, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC169A6NNP5 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC169A6NNP5 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC169A6NNP5 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC169A6NNP5 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC169A6NNP5 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC169A6NNP5 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC169A6NNP5 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC169A6NNP5 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC169A6NNP5 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC169A6NNP5 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC169A6NNP5 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CCDC169A6NNP5 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CCDC169A6NNP5 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CCDC169A6NNP5 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CCDC169A6NNP5 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CCDC169A6NNP5 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CCDC169A6NNP5 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CCDC169A6NNP5 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CCDC169A6NNP5 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CCDC169A6NNP5 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CCDC169A6NNP5 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CCDC169A6NNP5 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CCDC169A6NNP5 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC169A6NNP5 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC169A6NNP5 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC169A6NNP5 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC169A6NNP5 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC169A6NNP5 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC169A6NNP5 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC169A6NNP5 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC169A6NNP5 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC169A6NNP5 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC169A6NNP5 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC169A6NNP5 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC169A6NNP5 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC169A6NNP5 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC169A6NNP5 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC169A6NNP5 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC169A6NNP5 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC169A6NNP5 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC169A6NNP5 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC169A6NNP5 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC169A6NNP5 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC169A6NNP5 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC169A6NNP5 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC169A6NNP5 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC169A6NNP5 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC169A6NNP5 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC169A6NNP5 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC169A6NNP5 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC169A6NNP5 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC169A6NNP5 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC169A6NNP5 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC169A6NNP5 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC169A6NNP5 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC169A6NNP5 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC169A6NNP5 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC169A6NNP5 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC169A6NNP5 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC169A6NNP5 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC169A6NNP5 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC169A6NNP5 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC169A6NNP5 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC169A6NNP5 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC169A6NNP5 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC169A6NNP5 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC169A6NNP5 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC169A6NNP5 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC169A6NNP5 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC169A6NNP5 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC169A6NNP5 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC169A6NNP5 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC169A6NNP5 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC169A6NNP5 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC169A6NNP5 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC169A6NNP5 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC169A6NNP5 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC169A6NNP5 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC169A6NNP5 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC169A6NNP5 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC169A6NNP5 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC169A6NNP5 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC169A6NNP5 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC169A6NNP5 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC169A6NNP5 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC169A6NNP5 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC169A6NNP5 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC169A6NNP5 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC169A6NNP5 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC169A6NNP5 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC169A6NNP5 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC169A6NNP5 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC169A6NNP5 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC169A6NNP5 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC169A6NNP5 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC169A6NNP5 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC169A6NNP5 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC169A6NNP5 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC169A6NNP5 SYNGR1-203ENST00000328933 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC169A6NNP5 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.7 ms