Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBN7

HDAC6, Histone deacetylase 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC6Q9UBN7 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HDAC6Q9UBN7 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HDAC6Q9UBN7 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HDAC6Q9UBN7 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HDAC6Q9UBN7 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HDAC6Q9UBN7 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HDAC6Q9UBN7 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
HDAC6Q9UBN7 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HDAC6Q9UBN7 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HDAC6Q9UBN7 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HDAC6Q9UBN7 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HDAC6Q9UBN7 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HDAC6Q9UBN7 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HDAC6Q9UBN7 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
HDAC6Q9UBN7 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
HDAC6Q9UBN7 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HDAC6Q9UBN7 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
HDAC6Q9UBN7 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HDAC6Q9UBN7 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HDAC6Q9UBN7 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HDAC6Q9UBN7 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HDAC6Q9UBN7 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HDAC6Q9UBN7 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HDAC6Q9UBN7 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HDAC6Q9UBN7 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HDAC6Q9UBN7 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HDAC6Q9UBN7 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HDAC6Q9UBN7 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HDAC6Q9UBN7 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HDAC6Q9UBN7 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HDAC6Q9UBN7 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HDAC6Q9UBN7 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HDAC6Q9UBN7 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HDAC6Q9UBN7 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
HDAC6Q9UBN7 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HDAC6Q9UBN7 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
HDAC6Q9UBN7 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HDAC6Q9UBN7 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
HDAC6Q9UBN7 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HDAC6Q9UBN7 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HDAC6Q9UBN7 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HDAC6Q9UBN7 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HDAC6Q9UBN7 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HDAC6Q9UBN7 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HDAC6Q9UBN7 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HDAC6Q9UBN7 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HDAC6Q9UBN7 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HDAC6Q9UBN7 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HDAC6Q9UBN7 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HDAC6Q9UBN7 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HDAC6Q9UBN7 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HDAC6Q9UBN7 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HDAC6Q9UBN7 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HDAC6Q9UBN7 AC091046.1-201ENST00000331871 207 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
HDAC6Q9UBN7 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HDAC6Q9UBN7 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HDAC6Q9UBN7 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
HDAC6Q9UBN7 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HDAC6Q9UBN7 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
HDAC6Q9UBN7 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
HDAC6Q9UBN7 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HDAC6Q9UBN7 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
HDAC6Q9UBN7 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HDAC6Q9UBN7 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HDAC6Q9UBN7 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HDAC6Q9UBN7 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HDAC6Q9UBN7 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
HDAC6Q9UBN7 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HDAC6Q9UBN7 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
HDAC6Q9UBN7 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HDAC6Q9UBN7 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HDAC6Q9UBN7 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HDAC6Q9UBN7 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HDAC6Q9UBN7 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HDAC6Q9UBN7 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HDAC6Q9UBN7 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HDAC6Q9UBN7 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HDAC6Q9UBN7 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HDAC6Q9UBN7 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HDAC6Q9UBN7 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HDAC6Q9UBN7 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HDAC6Q9UBN7 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HDAC6Q9UBN7 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HDAC6Q9UBN7 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HDAC6Q9UBN7 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HDAC6Q9UBN7 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HDAC6Q9UBN7 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HDAC6Q9UBN7 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HDAC6Q9UBN7 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HDAC6Q9UBN7 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
HDAC6Q9UBN7 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HDAC6Q9UBN7 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
HDAC6Q9UBN7 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HDAC6Q9UBN7 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
HDAC6Q9UBN7 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HDAC6Q9UBN7 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HDAC6Q9UBN7 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HDAC6Q9UBN7 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HDAC6Q9UBN7 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HDAC6Q9UBN7 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms