Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FOXQ1Q9C009 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
FOXQ1Q9C009 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FOXQ1Q9C009 TMSB15A-201ENST00000289373 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FOXQ1Q9C009 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FOXQ1Q9C009 TRBV4-1-201ENST00000390357 373 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FOXQ1Q9C009 TRBV4-2-201ENST00000390392 455 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FOXQ1Q9C009 PTTG1IP-202ENST00000397886 755 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FOXQ1Q9C009 AC092580.1-201ENST00000433998 658 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
FOXQ1Q9C009 AC018638.5-201ENST00000450885 754 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
FOXQ1Q9C009 AL135901.1-201ENST00000451812 333 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
FOXQ1Q9C009 AP003390.1-201ENST00000533253 523 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FOXQ1Q9C009 AC027139.1-201ENST00000565286 951 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
FOXQ1Q9C009 C17orf62-216ENST00000578919 841 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FOXQ1Q9C009 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FOXQ1Q9C009 AC010632.2-201ENST00000588369 1224 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
FOXQ1Q9C009 AL118522.1-201ENST00000611368 560 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
FOXQ1Q9C009 AC010096.1-201ENST00000443897 1709 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FOXQ1Q9C009 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FOXQ1Q9C009 KCTD6-202ENST00000404589 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FOXQ1Q9C009 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FOXQ1Q9C009 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FOXQ1Q9C009 TMEM176B-204ENST00000447204 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FOXQ1Q9C009 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FOXQ1Q9C009 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FOXQ1Q9C009 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FOXQ1Q9C009 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FOXQ1Q9C009 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FOXQ1Q9C009 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FOXQ1Q9C009 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FOXQ1Q9C009 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FOXQ1Q9C009 UBL4B-201ENST00000334179 1478 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FOXQ1Q9C009 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FOXQ1Q9C009 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FOXQ1Q9C009 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
FOXQ1Q9C009 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FOXQ1Q9C009 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FOXQ1Q9C009 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FOXQ1Q9C009 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FOXQ1Q9C009 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FOXQ1Q9C009 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FOXQ1Q9C009 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FOXQ1Q9C009 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FOXQ1Q9C009 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FOXQ1Q9C009 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FOXQ1Q9C009 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
FOXQ1Q9C009 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FOXQ1Q9C009 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FOXQ1Q9C009 UQCC2-201ENST00000374214 432 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FOXQ1Q9C009 RPA3-202ENST00000396682 847 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FOXQ1Q9C009 NME4-203ENST00000397722 1232 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FOXQ1Q9C009 Metazoa_SRP.9-201ENST00000415635 283 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
FOXQ1Q9C009 FAM27E5-201ENST00000426869 682 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FOXQ1Q9C009 GNG10P1-201ENST00000452289 199 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
FOXQ1Q9C009 DMKN-229ENST00000467637 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FOXQ1Q9C009 RN7SL23P-201ENST00000484055 275 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
FOXQ1Q9C009 DMKN-256ENST00000492341 738 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FOXQ1Q9C009 AC093826.1-201ENST00000508655 993 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
FOXQ1Q9C009 ANAPC15-204ENST00000535234 848 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FOXQ1Q9C009 DUXAP9-201ENST00000547220 665 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FOXQ1Q9C009 ELP5-212ENST00000574255 671 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FOXQ1Q9C009 RN7SL665P-201ENST00000578793 300 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
FOXQ1Q9C009 OCEL1-206ENST00000597836 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FOXQ1Q9C009 FXYD3-204ENST00000603181 758 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FOXQ1Q9C009 AC006548.2-201ENST00000605217 529 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
FOXQ1Q9C009 LINC02018-201ENST00000608169 1268 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FOXQ1Q9C009 EAF1-AS1-208ENST00000608408 770 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FOXQ1Q9C009 AL137793.2-201ENST00000632635 659 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FOXQ1Q9C009 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FOXQ1Q9C009 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FOXQ1Q9C009 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
FOXQ1Q9C009 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FOXQ1Q9C009 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FOXQ1Q9C009 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FOXQ1Q9C009 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FOXQ1Q9C009 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FOXQ1Q9C009 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FOXQ1Q9C009 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FOXQ1Q9C009 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FOXQ1Q9C009 BRD7P5-201ENST00000299197 1822 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
FOXQ1Q9C009 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FOXQ1Q9C009 AL672207.1-201ENST00000328462 1570 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
FOXQ1Q9C009 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FOXQ1Q9C009 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FOXQ1Q9C009 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FOXQ1Q9C009 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FOXQ1Q9C009 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
FOXQ1Q9C009 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FOXQ1Q9C009 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FOXQ1Q9C009 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FOXQ1Q9C009 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FOXQ1Q9C009 MINDY4B-201ENST00000465419 1383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FOXQ1Q9C009 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FOXQ1Q9C009 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FOXQ1Q9C009 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FOXQ1Q9C009 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FOXQ1Q9C009 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FOXQ1Q9C009 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FOXQ1Q9C009 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FOXQ1Q9C009 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.4 ms