Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI5

SGIP1, SH3-containing GRB2-like protein 3-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGIP1Q9BQI5 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SGIP1Q9BQI5 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SGIP1Q9BQI5 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SGIP1Q9BQI5 HNRNPC-205ENST00000553300 1375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SGIP1Q9BQI5 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SGIP1Q9BQI5 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SGIP1Q9BQI5 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SGIP1Q9BQI5 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SGIP1Q9BQI5 GOLGA8K-202ENST00000512626 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SGIP1Q9BQI5 GOLGA8T-202ENST00000569052 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SGIP1Q9BQI5 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SGIP1Q9BQI5 BPIFA4P-201ENST00000375465 1203 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SGIP1Q9BQI5 UCN3-201ENST00000380433 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SGIP1Q9BQI5 IFITM1-202ENST00000408968 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SGIP1Q9BQI5 FTH1P18-201ENST00000412071 549 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
SGIP1Q9BQI5 AKT3-IT1-201ENST00000417120 517 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SGIP1Q9BQI5 LINC00399-201ENST00000439008 414 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SGIP1Q9BQI5 RPSAP70-201ENST00000504462 864 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
SGIP1Q9BQI5 AP003031.2-205ENST00000531263 683 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SGIP1Q9BQI5 EIF2B1-205ENST00000539951 848 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SGIP1Q9BQI5 AC002996.1-201ENST00000546840 784 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SGIP1Q9BQI5 AC090503.2-201ENST00000551135 981 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SGIP1Q9BQI5 GRAMD4P6-201ENST00000556999 244 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
SGIP1Q9BQI5 AC015912.3-201ENST00000619432 348 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
SGIP1Q9BQI5 AC009041.4-201ENST00000620075 638 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
SGIP1Q9BQI5 KCNQ1OT1_1.1-201ENST00000622358 464 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
SGIP1Q9BQI5 AL590556.2-202ENST00000636906 844 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
SGIP1Q9BQI5 Metazoa_SRP.210-201ENST00000637921 244 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
SGIP1Q9BQI5 PLEKHG6-202ENST00000304581 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SGIP1Q9BQI5 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SGIP1Q9BQI5 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SGIP1Q9BQI5 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SGIP1Q9BQI5 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SGIP1Q9BQI5 HMGA1-203ENST00000374116 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SGIP1Q9BQI5 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SGIP1Q9BQI5 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SGIP1Q9BQI5 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SGIP1Q9BQI5 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SGIP1Q9BQI5 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SGIP1Q9BQI5 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SGIP1Q9BQI5 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
SGIP1Q9BQI5 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SGIP1Q9BQI5 TTC23L-203ENST00000505624 1353 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SGIP1Q9BQI5 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SGIP1Q9BQI5 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SGIP1Q9BQI5 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SGIP1Q9BQI5 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SGIP1Q9BQI5 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
SGIP1Q9BQI5 DERL3-202ENST00000318109 860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SGIP1Q9BQI5 ASS1P1-201ENST00000402854 1237 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
SGIP1Q9BQI5 AL158207.2-201ENST00000414926 266 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SGIP1Q9BQI5 DMKN-211ENST00000436012 848 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SGIP1Q9BQI5 AC093106.1-201ENST00000437271 352 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
SGIP1Q9BQI5 RNF181-203ENST00000441634 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SGIP1Q9BQI5 LINC01370-202ENST00000445606 731 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SGIP1Q9BQI5 AL445471.1-201ENST00000456316 820 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SGIP1Q9BQI5 FAM86JP-202ENST00000484500 988 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
SGIP1Q9BQI5 AC090833.1-202ENST00000511073 781 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SGIP1Q9BQI5 AC073896.3-201ENST00000546789 437 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SGIP1Q9BQI5 MT3-202ENST00000561640 514 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SGIP1Q9BQI5 CHD2-218ENST00000629346 1249 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SGIP1Q9BQI5 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SGIP1Q9BQI5 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SGIP1Q9BQI5 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SGIP1Q9BQI5 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SGIP1Q9BQI5 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SGIP1Q9BQI5 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SGIP1Q9BQI5 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SGIP1Q9BQI5 METTL6-202ENST00000383790 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SGIP1Q9BQI5 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SGIP1Q9BQI5 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SGIP1Q9BQI5 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SGIP1Q9BQI5 TMEM56-RWDD3-202ENST00000604534 1491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SGIP1Q9BQI5 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SGIP1Q9BQI5 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SGIP1Q9BQI5 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SGIP1Q9BQI5 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SGIP1Q9BQI5 LILRP2-202ENST00000413572 1383 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SGIP1Q9BQI5 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SGIP1Q9BQI5 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SGIP1Q9BQI5 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SGIP1Q9BQI5 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SGIP1Q9BQI5 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SGIP1Q9BQI5 PDCD6-201ENST00000264933 1135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SGIP1Q9BQI5 TAMM41-201ENST00000273037 1297 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SGIP1Q9BQI5 CD44-203ENST00000278386 484 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SGIP1Q9BQI5 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SGIP1Q9BQI5 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SGIP1Q9BQI5 AC131011.1-201ENST00000366134 672 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SGIP1Q9BQI5 VASH2-205ENST00000366967 1206 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SGIP1Q9BQI5 S100A2-202ENST00000368708 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SGIP1Q9BQI5 IGHV3-66-201ENST00000390632 427 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SGIP1Q9BQI5 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SGIP1Q9BQI5 KRT18P33-201ENST00000398525 1043 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SGIP1Q9BQI5 AC092810.2-201ENST00000431570 362 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SGIP1Q9BQI5 MED19-202ENST00000431606 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SGIP1Q9BQI5 FAM157A-201ENST00000437428 1141 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SGIP1Q9BQI5 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SGIP1Q9BQI5 PSME2P2-201ENST00000453033 700 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SGIP1Q9BQI5 LINC00887-204ENST00000456816 796 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms