Protein–RNA interactions for Protein: Q9BPW8

NIPSNAP1, Protein NipSnap homolog 1, humanhuman

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Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP1Q9BPW8 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
NIPSNAP1Q9BPW8 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC13.52□□□□□ -0.25
NIPSNAP1Q9BPW8 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
NIPSNAP1Q9BPW8 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
NIPSNAP1Q9BPW8 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
NIPSNAP1Q9BPW8 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
NIPSNAP1Q9BPW8 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
NIPSNAP1Q9BPW8 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.52□□□□□ -0.25
NIPSNAP1Q9BPW8 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
NIPSNAP1Q9BPW8 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
NIPSNAP1Q9BPW8 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
NIPSNAP1Q9BPW8 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
NIPSNAP1Q9BPW8 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
NIPSNAP1Q9BPW8 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
NIPSNAP1Q9BPW8 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
NIPSNAP1Q9BPW8 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
NIPSNAP1Q9BPW8 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
NIPSNAP1Q9BPW8 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
NIPSNAP1Q9BPW8 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
NIPSNAP1Q9BPW8 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
NIPSNAP1Q9BPW8 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
NIPSNAP1Q9BPW8 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
NIPSNAP1Q9BPW8 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
NIPSNAP1Q9BPW8 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
NIPSNAP1Q9BPW8 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
NIPSNAP1Q9BPW8 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
NIPSNAP1Q9BPW8 ZBP1-201ENST00000371173 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
NIPSNAP1Q9BPW8 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
NIPSNAP1Q9BPW8 PNRC2-201ENST00000334351 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
NIPSNAP1Q9BPW8 AOC1-201ENST00000360937 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
NIPSNAP1Q9BPW8 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
NIPSNAP1Q9BPW8 POMT1-201ENST00000341012 2912 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
NIPSNAP1Q9BPW8 VASH2-202ENST00000366964 2960 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
NIPSNAP1Q9BPW8 APOB-202ENST00000399256 3128 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
NIPSNAP1Q9BPW8 SLC35G1-201ENST00000371408 3490 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
NIPSNAP1Q9BPW8 EBLN3P-202ENST00000625445 4520 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
NIPSNAP1Q9BPW8 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
NIPSNAP1Q9BPW8 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
NIPSNAP1Q9BPW8 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NIPSNAP1Q9BPW8 SSTR1-201ENST00000267377 4295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
NIPSNAP1Q9BPW8 PPP6R2-202ENST00000359139 4035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
NIPSNAP1Q9BPW8 PARP1-203ENST00000366794 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NIPSNAP1Q9BPW8 ZC2HC1A-201ENST00000263849 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NIPSNAP1Q9BPW8 SEMA7A-202ENST00000542748 3228 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
NIPSNAP1Q9BPW8 TMEM63B-202ENST00000323267 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
NIPSNAP1Q9BPW8 TUNAR-201ENST00000503525 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NIPSNAP1Q9BPW8 VPS52-212ENST00000445902 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NIPSNAP1Q9BPW8 PGBD2-202ENST00000355360 2879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NIPSNAP1Q9BPW8 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NIPSNAP1Q9BPW8 PLA2G3-201ENST00000215885 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NIPSNAP1Q9BPW8 DMTN-214ENST00000519907 2658 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
NIPSNAP1Q9BPW8 AGAP5-201ENST00000374094 2394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NIPSNAP1Q9BPW8 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
NIPSNAP1Q9BPW8 MOG-221ENST00000376917 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NIPSNAP1Q9BPW8 ERICH6-201ENST00000295910 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NIPSNAP1Q9BPW8 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NIPSNAP1Q9BPW8 MEAF6-203ENST00000373074 2005 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
NIPSNAP1Q9BPW8 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
NIPSNAP1Q9BPW8 AC068760.1-201ENST00000493579 1953 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
NIPSNAP1Q9BPW8 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
NIPSNAP1Q9BPW8 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
NIPSNAP1Q9BPW8 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NIPSNAP1Q9BPW8 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
NIPSNAP1Q9BPW8 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
NIPSNAP1Q9BPW8 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
NIPSNAP1Q9BPW8 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
NIPSNAP1Q9BPW8 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NIPSNAP1Q9BPW8 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NIPSNAP1Q9BPW8 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NIPSNAP1Q9BPW8 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NIPSNAP1Q9BPW8 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NIPSNAP1Q9BPW8 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
NIPSNAP1Q9BPW8 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
NIPSNAP1Q9BPW8 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NIPSNAP1Q9BPW8 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
NIPSNAP1Q9BPW8 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
NIPSNAP1Q9BPW8 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
NIPSNAP1Q9BPW8 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
NIPSNAP1Q9BPW8 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
NIPSNAP1Q9BPW8 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
NIPSNAP1Q9BPW8 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NIPSNAP1Q9BPW8 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
NIPSNAP1Q9BPW8 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
NIPSNAP1Q9BPW8 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
NIPSNAP1Q9BPW8 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
NIPSNAP1Q9BPW8 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.51□□□□□ -0.25
NIPSNAP1Q9BPW8 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC13.51□□□□□ -0.25
NIPSNAP1Q9BPW8 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
NIPSNAP1Q9BPW8 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
NIPSNAP1Q9BPW8 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
NIPSNAP1Q9BPW8 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
NIPSNAP1Q9BPW8 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
NIPSNAP1Q9BPW8 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NIPSNAP1Q9BPW8 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NIPSNAP1Q9BPW8 RNF145-202ENST00000424310 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NIPSNAP1Q9BPW8 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NIPSNAP1Q9BPW8 TDRD5-201ENST00000294848 3525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NIPSNAP1Q9BPW8 ADCY8-202ENST00000377928 3363 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NIPSNAP1Q9BPW8 PSIP1-203ENST00000380733 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NIPSNAP1Q9BPW8 PSIP1-204ENST00000380738 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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