Protein–RNA interactions for Protein: Q96L08

SUSD3, Sushi domain-containing protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD3Q96L08 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SUSD3Q96L08 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SUSD3Q96L08 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SUSD3Q96L08 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SUSD3Q96L08 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SUSD3Q96L08 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SUSD3Q96L08 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SUSD3Q96L08 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SUSD3Q96L08 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SUSD3Q96L08 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SUSD3Q96L08 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SUSD3Q96L08 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SUSD3Q96L08 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SUSD3Q96L08 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SUSD3Q96L08 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SUSD3Q96L08 AP002353.1-201ENST00000528257 1599 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SUSD3Q96L08 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SUSD3Q96L08 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SUSD3Q96L08 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SUSD3Q96L08 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SUSD3Q96L08 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SUSD3Q96L08 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SUSD3Q96L08 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SUSD3Q96L08 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SUSD3Q96L08 PBDC1-201ENST00000373357 977 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SUSD3Q96L08 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SUSD3Q96L08 RPL3-202ENST00000401609 1289 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SUSD3Q96L08 LINC00686-201ENST00000435412 332 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SUSD3Q96L08 AC114488.1-201ENST00000435872 591 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SUSD3Q96L08 SERPINA7P1-201ENST00000443077 631 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SUSD3Q96L08 LINC00322-201ENST00000450205 699 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SUSD3Q96L08 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SUSD3Q96L08 PGRMC2-206ENST00000512483 1144 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SUSD3Q96L08 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SUSD3Q96L08 NAT9-220ENST00000582870 896 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SUSD3Q96L08 AL022334.2-201ENST00000610000 484 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SUSD3Q96L08 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SUSD3Q96L08 AC090386.2-201ENST00000623010 1039 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SUSD3Q96L08 AL353726.2-201ENST00000623259 884 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SUSD3Q96L08 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SUSD3Q96L08 ACTG1P17-202ENST00000560958 1662 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SUSD3Q96L08 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SUSD3Q96L08 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SUSD3Q96L08 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SUSD3Q96L08 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SUSD3Q96L08 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SUSD3Q96L08 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SUSD3Q96L08 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SUSD3Q96L08 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SUSD3Q96L08 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SUSD3Q96L08 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SUSD3Q96L08 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SUSD3Q96L08 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SUSD3Q96L08 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SUSD3Q96L08 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SUSD3Q96L08 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SUSD3Q96L08 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SUSD3Q96L08 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SUSD3Q96L08 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SUSD3Q96L08 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SUSD3Q96L08 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SUSD3Q96L08 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SUSD3Q96L08 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SUSD3Q96L08 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SUSD3Q96L08 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SUSD3Q96L08 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SUSD3Q96L08 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SUSD3Q96L08 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SUSD3Q96L08 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SUSD3Q96L08 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SUSD3Q96L08 PRIMA1-201ENST00000316227 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SUSD3Q96L08 MAD2L2-206ENST00000376672 1002 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SUSD3Q96L08 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SUSD3Q96L08 ANKDD1A-203ENST00000395723 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SUSD3Q96L08 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SUSD3Q96L08 GGCT-203ENST00000409144 836 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SUSD3Q96L08 BANF1P3-201ENST00000412556 261 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SUSD3Q96L08 HINT2P1-201ENST00000419438 481 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SUSD3Q96L08 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SUSD3Q96L08 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SUSD3Q96L08 HCFC1-AS1-201ENST00000438219 350 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SUSD3Q96L08 FTLP1-201ENST00000449155 526 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SUSD3Q96L08 RN7SL530P-201ENST00000485097 298 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SUSD3Q96L08 AC019193.1-201ENST00000506678 823 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SUSD3Q96L08 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SUSD3Q96L08 GGCT-201ENST00000005374 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SUSD3Q96L08 AC040162.4-201ENST00000574912 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SUSD3Q96L08 AC008743.1-201ENST00000596350 813 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SUSD3Q96L08 AC008763.1-201ENST00000601797 843 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SUSD3Q96L08 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SUSD3Q96L08 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SUSD3Q96L08 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SUSD3Q96L08 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SUSD3Q96L08 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SUSD3Q96L08 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SUSD3Q96L08 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SUSD3Q96L08 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SUSD3Q96L08 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SUSD3Q96L08 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SUSD3Q96L08 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
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