Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXD2

SCG3, Secretogranin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 468 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCG3Q8WXD2 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SCG3Q8WXD2 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SCG3Q8WXD2 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SCG3Q8WXD2 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SCG3Q8WXD2 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SCG3Q8WXD2 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SCG3Q8WXD2 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SCG3Q8WXD2 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SCG3Q8WXD2 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SCG3Q8WXD2 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SCG3Q8WXD2 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SCG3Q8WXD2 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SCG3Q8WXD2 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SCG3Q8WXD2 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SCG3Q8WXD2 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SCG3Q8WXD2 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SCG3Q8WXD2 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SCG3Q8WXD2 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SCG3Q8WXD2 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SCG3Q8WXD2 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SCG3Q8WXD2 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SCG3Q8WXD2 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SCG3Q8WXD2 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SCG3Q8WXD2 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SCG3Q8WXD2 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SCG3Q8WXD2 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SCG3Q8WXD2 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SCG3Q8WXD2 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SCG3Q8WXD2 AC013460.1-202ENST00000435062 2253 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SCG3Q8WXD2 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SCG3Q8WXD2 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SCG3Q8WXD2 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SCG3Q8WXD2 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SCG3Q8WXD2 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SCG3Q8WXD2 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SCG3Q8WXD2 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SCG3Q8WXD2 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SCG3Q8WXD2 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SCG3Q8WXD2 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SCG3Q8WXD2 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SCG3Q8WXD2 HCG24-202ENST00000414398 717 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SCG3Q8WXD2 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SCG3Q8WXD2 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SCG3Q8WXD2 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SCG3Q8WXD2 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SCG3Q8WXD2 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SCG3Q8WXD2 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SCG3Q8WXD2 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SCG3Q8WXD2 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SCG3Q8WXD2 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SCG3Q8WXD2 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SCG3Q8WXD2 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SCG3Q8WXD2 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SCG3Q8WXD2 LINC02536-201ENST00000625799 625 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SCG3Q8WXD2 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SCG3Q8WXD2 DSN1-203ENST00000373750 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SCG3Q8WXD2 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SCG3Q8WXD2 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SCG3Q8WXD2 DMTN-214ENST00000519907 2658 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SCG3Q8WXD2 EIF4G1-218ENST00000434061 5026 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SCG3Q8WXD2 INF2-209ENST00000617571 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SCG3Q8WXD2 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SCG3Q8WXD2 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SCG3Q8WXD2 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SCG3Q8WXD2 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SCG3Q8WXD2 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SCG3Q8WXD2 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SCG3Q8WXD2 DEPTOR-201ENST00000286234 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SCG3Q8WXD2 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SCG3Q8WXD2 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SCG3Q8WXD2 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SCG3Q8WXD2 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SCG3Q8WXD2 FXYD6-207ENST00000527717 1799 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SCG3Q8WXD2 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SCG3Q8WXD2 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SCG3Q8WXD2 SBF1-202ENST00000380817 8008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SCG3Q8WXD2 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SCG3Q8WXD2 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SCG3Q8WXD2 LHX1-201ENST00000614239 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SCG3Q8WXD2 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SCG3Q8WXD2 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SCG3Q8WXD2 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SCG3Q8WXD2 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SCG3Q8WXD2 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SCG3Q8WXD2 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SCG3Q8WXD2 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SCG3Q8WXD2 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SCG3Q8WXD2 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SCG3Q8WXD2 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SCG3Q8WXD2 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SCG3Q8WXD2 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SCG3Q8WXD2 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SCG3Q8WXD2 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SCG3Q8WXD2 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SCG3Q8WXD2 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SCG3Q8WXD2 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SCG3Q8WXD2 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SCG3Q8WXD2 KCNH6-202ENST00000456941 2928 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SCG3Q8WXD2 GALNT3-201ENST00000392701 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SCG3Q8WXD2 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
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