Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4E4

PDCL2, Phosducin-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCL2Q8N4E4 FUT1-201ENST00000310160 4246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PDCL2Q8N4E4 HADH-202ENST00000403312 1752 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PDCL2Q8N4E4 GPT2-201ENST00000340124 3984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PDCL2Q8N4E4 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PDCL2Q8N4E4 PCDHA2-202ENST00000520672 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PDCL2Q8N4E4 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PDCL2Q8N4E4 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PDCL2Q8N4E4 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PDCL2Q8N4E4 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PDCL2Q8N4E4 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PDCL2Q8N4E4 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PDCL2Q8N4E4 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PDCL2Q8N4E4 YTHDF3-205ENST00000539294 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PDCL2Q8N4E4 RBFADN-204ENST00000568911 5187 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PDCL2Q8N4E4 ITGAM-202ENST00000544665 4718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PDCL2Q8N4E4 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PDCL2Q8N4E4 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PDCL2Q8N4E4 LRRC20-201ENST00000355790 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PDCL2Q8N4E4 WWC2-201ENST00000403733 8826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PDCL2Q8N4E4 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PDCL2Q8N4E4 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PDCL2Q8N4E4 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PDCL2Q8N4E4 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PDCL2Q8N4E4 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PDCL2Q8N4E4 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PDCL2Q8N4E4 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PDCL2Q8N4E4 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PDCL2Q8N4E4 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PDCL2Q8N4E4 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PDCL2Q8N4E4 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PDCL2Q8N4E4 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PDCL2Q8N4E4 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PDCL2Q8N4E4 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PDCL2Q8N4E4 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PDCL2Q8N4E4 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PDCL2Q8N4E4 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PDCL2Q8N4E4 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PDCL2Q8N4E4 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PDCL2Q8N4E4 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PDCL2Q8N4E4 SFMBT2-203ENST00000379713 2402 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PDCL2Q8N4E4 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PDCL2Q8N4E4 OS9-201ENST00000257966 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PDCL2Q8N4E4 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PDCL2Q8N4E4 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PDCL2Q8N4E4 DENND1C-202ENST00000543576 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
PDCL2Q8N4E4 TBL3-208ENST00000615855 2472 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
PDCL2Q8N4E4 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
PDCL2Q8N4E4 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PDCL2Q8N4E4 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PDCL2Q8N4E4 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PDCL2Q8N4E4 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PDCL2Q8N4E4 NCBP2-204ENST00000427641 1946 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PDCL2Q8N4E4 BAK1-202ENST00000374467 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PDCL2Q8N4E4 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PDCL2Q8N4E4 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PDCL2Q8N4E4 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PDCL2Q8N4E4 PNPLA5-205ENST00000597664 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PDCL2Q8N4E4 MAP3K12-203ENST00000547035 2944 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PDCL2Q8N4E4 TOR1AIP1-201ENST00000271583 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PDCL2Q8N4E4 DPP8-202ENST00000321147 3125 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PDCL2Q8N4E4 GNAS-213ENST00000371099 3709 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PDCL2Q8N4E4 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PDCL2Q8N4E4 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PDCL2Q8N4E4 PLIN4-202ENST00000633942 6484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PDCL2Q8N4E4 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PDCL2Q8N4E4 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PDCL2Q8N4E4 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PDCL2Q8N4E4 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PDCL2Q8N4E4 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PDCL2Q8N4E4 NDFIP2-205ENST00000612570 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PDCL2Q8N4E4 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PDCL2Q8N4E4 TNFAIP8L1-201ENST00000327473 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PDCL2Q8N4E4 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PDCL2Q8N4E4 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PDCL2Q8N4E4 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PDCL2Q8N4E4 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PDCL2Q8N4E4 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PDCL2Q8N4E4 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PDCL2Q8N4E4 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PDCL2Q8N4E4 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PDCL2Q8N4E4 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PDCL2Q8N4E4 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PDCL2Q8N4E4 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PDCL2Q8N4E4 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PDCL2Q8N4E4 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PDCL2Q8N4E4 TNFAIP8L1-202ENST00000536716 3845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PDCL2Q8N4E4 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PDCL2Q8N4E4 KIAA0319-204ENST00000537886 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PDCL2Q8N4E4 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PDCL2Q8N4E4 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PDCL2Q8N4E4 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PDCL2Q8N4E4 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PDCL2Q8N4E4 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PDCL2Q8N4E4 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PDCL2Q8N4E4 GPN2-202ENST00000374135 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PDCL2Q8N4E4 PTPN23-201ENST00000265562 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PDCL2Q8N4E4 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PDCL2Q8N4E4 ZNF641-201ENST00000301042 4544 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PDCL2Q8N4E4 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PDCL2Q8N4E4 SLC1A7-202ENST00000371494 2637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms