Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTS3

PTF1A, Pancreas transcription factor 1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTF1AQ7RTS3 AP005264.5-201ENST00000590066 467 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PTF1AQ7RTS3 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTF1AQ7RTS3 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTF1AQ7RTS3 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTF1AQ7RTS3 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTF1AQ7RTS3 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTF1AQ7RTS3 HMGA1-203ENST00000374116 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTF1AQ7RTS3 VIPAS39-208ENST00000556412 1832 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTF1AQ7RTS3 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTF1AQ7RTS3 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTF1AQ7RTS3 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTF1AQ7RTS3 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTF1AQ7RTS3 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTF1AQ7RTS3 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTF1AQ7RTS3 ANXA5-202ENST00000501272 1363 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTF1AQ7RTS3 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTF1AQ7RTS3 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTF1AQ7RTS3 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTF1AQ7RTS3 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTF1AQ7RTS3 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PTF1AQ7RTS3 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTF1AQ7RTS3 NCF4-202ENST00000397147 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTF1AQ7RTS3 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTF1AQ7RTS3 CSHL1-201ENST00000259003 739 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTF1AQ7RTS3 CCL25-202ENST00000315626 450 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTF1AQ7RTS3 MRPL18-201ENST00000367034 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTF1AQ7RTS3 AQP7-202ENST00000377425 1068 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTF1AQ7RTS3 AC136604.1-202ENST00000425471 771 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PTF1AQ7RTS3 SOD2-205ENST00000444946 917 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTF1AQ7RTS3 CSHL1-206ENST00000450719 973 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTF1AQ7RTS3 HIST1H2APS2-201ENST00000454426 370 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PTF1AQ7RTS3 TMEM14B-208ENST00000467317 1224 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTF1AQ7RTS3 PRSS3P1-201ENST00000503996 742 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PTF1AQ7RTS3 AC009487.3-201ENST00000505579 560 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTF1AQ7RTS3 DHDDS-217ENST00000526219 1072 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTF1AQ7RTS3 TPP1-209ENST00000528657 578 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTF1AQ7RTS3 AC073896.4-201ENST00000553176 403 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTF1AQ7RTS3 DLK1-205ENST00000556051 469 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTF1AQ7RTS3 AC140658.4-201ENST00000561990 352 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PTF1AQ7RTS3 AC008906.2-201ENST00000606656 474 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTF1AQ7RTS3 AL359091.4-201ENST00000610052 409 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PTF1AQ7RTS3 AC126755.5-201ENST00000622756 267 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PTF1AQ7RTS3 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTF1AQ7RTS3 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTF1AQ7RTS3 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTF1AQ7RTS3 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTF1AQ7RTS3 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTF1AQ7RTS3 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTF1AQ7RTS3 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTF1AQ7RTS3 KLK4-201ENST00000324041 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTF1AQ7RTS3 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTF1AQ7RTS3 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTF1AQ7RTS3 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTF1AQ7RTS3 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTF1AQ7RTS3 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTF1AQ7RTS3 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTF1AQ7RTS3 CCNG2-202ENST00000395640 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTF1AQ7RTS3 AC062028.1-201ENST00000536743 1422 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTF1AQ7RTS3 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTF1AQ7RTS3 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTF1AQ7RTS3 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTF1AQ7RTS3 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTF1AQ7RTS3 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTF1AQ7RTS3 HIST1H2BK-201ENST00000356950 381 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTF1AQ7RTS3 PPM1N-203ENST00000396737 872 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTF1AQ7RTS3 SKOR2-201ENST00000400404 891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTF1AQ7RTS3 PPP1R7-205ENST00000404405 1009 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTF1AQ7RTS3 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTF1AQ7RTS3 AC092573.1-201ENST00000433054 884 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PTF1AQ7RTS3 CU639417.1-201ENST00000464664 460 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTF1AQ7RTS3 MUSTN1-202ENST00000486659 622 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTF1AQ7RTS3 AC015795.2-201ENST00000512720 575 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTF1AQ7RTS3 RPL18-205ENST00000549273 1036 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTF1AQ7RTS3 SLC9A3R2-204ENST00000563587 1037 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTF1AQ7RTS3 SKA2-205ENST00000580541 689 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTF1AQ7RTS3 MIR4265-201ENST00000582152 99 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PTF1AQ7RTS3 USP32P3-202ENST00000583574 611 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTF1AQ7RTS3 H2BFS-201ENST00000599962 460 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTF1AQ7RTS3 AL136982.5-201ENST00000605222 294 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PTF1AQ7RTS3 AC080013.5-201ENST00000607044 679 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PTF1AQ7RTS3 AC004466.2-201ENST00000614749 516 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PTF1AQ7RTS3 HPX-213ENST00000615166 826 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTF1AQ7RTS3 AL135936.1-201ENST00000617956 998 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTF1AQ7RTS3 AC010531.8-201ENST00000623341 685 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PTF1AQ7RTS3 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTF1AQ7RTS3 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTF1AQ7RTS3 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTF1AQ7RTS3 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTF1AQ7RTS3 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTF1AQ7RTS3 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTF1AQ7RTS3 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTF1AQ7RTS3 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTF1AQ7RTS3 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTF1AQ7RTS3 SLC25A31-201ENST00000281154 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTF1AQ7RTS3 B3GNTL1-201ENST00000320865 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTF1AQ7RTS3 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTF1AQ7RTS3 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTF1AQ7RTS3 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTF1AQ7RTS3 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTF1AQ7RTS3 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms