Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZUS6

CCDC149, Coiled-coil domain-containing protein 149, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC149Q6ZUS6 ZDHHC4-204ENST00000396709 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC149Q6ZUS6 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC149Q6ZUS6 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC149Q6ZUS6 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC149Q6ZUS6 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC149Q6ZUS6 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC149Q6ZUS6 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC149Q6ZUS6 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC149Q6ZUS6 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC149Q6ZUS6 AC245100.1-201ENST00000452996 1331 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC149Q6ZUS6 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC149Q6ZUS6 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC149Q6ZUS6 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC149Q6ZUS6 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC149Q6ZUS6 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC149Q6ZUS6 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC149Q6ZUS6 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC149Q6ZUS6 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC149Q6ZUS6 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC149Q6ZUS6 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC149Q6ZUS6 TMSB10-201ENST00000233143 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC149Q6ZUS6 PPIE-202ENST00000356511 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC149Q6ZUS6 AL139339.1-201ENST00000411906 657 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC149Q6ZUS6 OSMR-AS1-202ENST00000512519 837 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC149Q6ZUS6 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC149Q6ZUS6 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC149Q6ZUS6 DNM1P30-201ENST00000563586 452 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC149Q6ZUS6 MIR3677-201ENST00000578964 60 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC149Q6ZUS6 RPL19-207ENST00000582193 792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC149Q6ZUS6 PARD6G-AS1-205ENST00000589574 647 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC149Q6ZUS6 AC111170.1-201ENST00000591110 1132 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC149Q6ZUS6 AC018755.3-203ENST00000597710 411 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC149Q6ZUS6 AC138894.2-201ENST00000602838 371 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC149Q6ZUS6 AC007881.3-201ENST00000608897 607 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC149Q6ZUS6 C15orf59-AS1-202ENST00000615095 1224 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC149Q6ZUS6 SRSF3-208ENST00000620941 869 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC149Q6ZUS6 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC149Q6ZUS6 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC149Q6ZUS6 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC149Q6ZUS6 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC149Q6ZUS6 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC149Q6ZUS6 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC149Q6ZUS6 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC149Q6ZUS6 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC149Q6ZUS6 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC149Q6ZUS6 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC149Q6ZUS6 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC149Q6ZUS6 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC149Q6ZUS6 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC149Q6ZUS6 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC149Q6ZUS6 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC149Q6ZUS6 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC149Q6ZUS6 SERF2-201ENST00000249786 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC149Q6ZUS6 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC149Q6ZUS6 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC149Q6ZUS6 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC149Q6ZUS6 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC149Q6ZUS6 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC149Q6ZUS6 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC149Q6ZUS6 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC149Q6ZUS6 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC149Q6ZUS6 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC149Q6ZUS6 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC149Q6ZUS6 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC149Q6ZUS6 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC149Q6ZUS6 PSMB10-201ENST00000358514 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC149Q6ZUS6 IGHV3-49-201ENST00000390625 439 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC149Q6ZUS6 AC005392.1-201ENST00000419624 500 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC149Q6ZUS6 RHBDD2-203ENST00000428119 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC149Q6ZUS6 TSPY25P-201ENST00000429463 745 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC149Q6ZUS6 CSHL1-205ENST00000438387 566 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC149Q6ZUS6 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC149Q6ZUS6 BUD31-205ENST00000456893 512 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC149Q6ZUS6 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC149Q6ZUS6 LINC02440-201ENST00000545276 680 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC149Q6ZUS6 FOS-204ENST00000554617 796 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC149Q6ZUS6 AL845331.2-201ENST00000561882 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC149Q6ZUS6 AQP8-202ENST00000566125 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC149Q6ZUS6 AC005632.3-201ENST00000605544 308 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC149Q6ZUS6 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC149Q6ZUS6 MIR6842-201ENST00000612539 65 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC149Q6ZUS6 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC149Q6ZUS6 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC149Q6ZUS6 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC149Q6ZUS6 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC149Q6ZUS6 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC149Q6ZUS6 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC149Q6ZUS6 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC149Q6ZUS6 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC149Q6ZUS6 AC025271.4-201ENST00000621477 1726 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC149Q6ZUS6 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC149Q6ZUS6 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC149Q6ZUS6 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC149Q6ZUS6 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC149Q6ZUS6 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC149Q6ZUS6 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC149Q6ZUS6 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC149Q6ZUS6 CYP51A1P3-201ENST00000400072 1428 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC149Q6ZUS6 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC149Q6ZUS6 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68 ms