Protein–RNA interactions for Protein: Q68J44

DUPD1, Dual specificity phosphatase DUPD1, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUPD1Q68J44 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DUPD1Q68J44 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DUPD1Q68J44 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DUPD1Q68J44 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DUPD1Q68J44 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DUPD1Q68J44 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DUPD1Q68J44 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DUPD1Q68J44 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
DUPD1Q68J44 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DUPD1Q68J44 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DUPD1Q68J44 PML-202ENST00000268059 3029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DUPD1Q68J44 AC015712.2-202ENST00000560068 3213 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DUPD1Q68J44 ZNF135-205ENST00000511556 2253 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DUPD1Q68J44 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DUPD1Q68J44 RNF41-202ENST00000394013 2452 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DUPD1Q68J44 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DUPD1Q68J44 SPATA20-227ENST00000634597 2587 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DUPD1Q68J44 FAM109A-201ENST00000361483 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DUPD1Q68J44 ATP2B2-210ENST00000638646 3465 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DUPD1Q68J44 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DUPD1Q68J44 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DUPD1Q68J44 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DUPD1Q68J44 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DUPD1Q68J44 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DUPD1Q68J44 DSN1-207ENST00000448110 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DUPD1Q68J44 TOX2-202ENST00000358131 2605 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DUPD1Q68J44 STK3-201ENST00000419617 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DUPD1Q68J44 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DUPD1Q68J44 TMPRSS6-203ENST00000406725 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DUPD1Q68J44 OSBPL2-201ENST00000313733 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DUPD1Q68J44 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DUPD1Q68J44 IL20RA-207ENST00000541547 3382 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DUPD1Q68J44 NUTM2E-201ENST00000429984 3292 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DUPD1Q68J44 IL12RB1-203ENST00000593993 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DUPD1Q68J44 SMAGP-203ENST00000603798 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DUPD1Q68J44 GDPD2-204ENST00000536730 2171 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DUPD1Q68J44 TACR2-201ENST00000373306 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DUPD1Q68J44 ADAM17-203ENST00000497134 1873 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DUPD1Q68J44 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DUPD1Q68J44 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DUPD1Q68J44 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DUPD1Q68J44 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DUPD1Q68J44 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DUPD1Q68J44 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DUPD1Q68J44 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DUPD1Q68J44 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DUPD1Q68J44 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DUPD1Q68J44 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DUPD1Q68J44 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DUPD1Q68J44 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DUPD1Q68J44 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DUPD1Q68J44 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DUPD1Q68J44 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DUPD1Q68J44 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DUPD1Q68J44 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DUPD1Q68J44 SFSWAP-210ENST00000541286 3219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DUPD1Q68J44 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DUPD1Q68J44 LRSAM1-203ENST00000373322 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DUPD1Q68J44 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DUPD1Q68J44 XG-201ENST00000381174 2315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DUPD1Q68J44 MAGI3-202ENST00000369611 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DUPD1Q68J44 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DUPD1Q68J44 MAN2B1-203ENST00000456935 3184 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DUPD1Q68J44 IL1RN-201ENST00000259206 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DUPD1Q68J44 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DUPD1Q68J44 AC114689.3-201ENST00000583687 2991 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DUPD1Q68J44 IL13RA1-202ENST00000371666 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DUPD1Q68J44 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DUPD1Q68J44 ABCG8-201ENST00000272286 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DUPD1Q68J44 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DUPD1Q68J44 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DUPD1Q68J44 APOB-202ENST00000399256 3128 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DUPD1Q68J44 AGFG1-204ENST00000409315 2912 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DUPD1Q68J44 NCLP1-201ENST00000445357 1963 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
DUPD1Q68J44 CCDC86-201ENST00000227520 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DUPD1Q68J44 GRHL1-202ENST00000405379 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DUPD1Q68J44 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DUPD1Q68J44 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DUPD1Q68J44 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DUPD1Q68J44 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DUPD1Q68J44 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DUPD1Q68J44 RBBP8NL-201ENST00000252998 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DUPD1Q68J44 ITGB3-201ENST00000559488 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DUPD1Q68J44 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DUPD1Q68J44 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DUPD1Q68J44 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DUPD1Q68J44 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DUPD1Q68J44 DNM2-204ENST00000408974 3013 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DUPD1Q68J44 DMPK-219ENST00000600757 3357 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DUPD1Q68J44 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DUPD1Q68J44 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DUPD1Q68J44 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
DUPD1Q68J44 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DUPD1Q68J44 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
DUPD1Q68J44 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DUPD1Q68J44 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
DUPD1Q68J44 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DUPD1Q68J44 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DUPD1Q68J44 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
DUPD1Q68J44 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms