Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSL9

STRIP1, Striatin-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRIP1Q5VSL9 AC010096.1-201ENST00000443897 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
STRIP1Q5VSL9 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
STRIP1Q5VSL9 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
STRIP1Q5VSL9 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
STRIP1Q5VSL9 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
STRIP1Q5VSL9 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
STRIP1Q5VSL9 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
STRIP1Q5VSL9 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
STRIP1Q5VSL9 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
STRIP1Q5VSL9 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
STRIP1Q5VSL9 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
STRIP1Q5VSL9 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
STRIP1Q5VSL9 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
STRIP1Q5VSL9 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
STRIP1Q5VSL9 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
STRIP1Q5VSL9 POLR3K-201ENST00000293860 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
STRIP1Q5VSL9 PYY2-201ENST00000315776 282 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
STRIP1Q5VSL9 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
STRIP1Q5VSL9 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
STRIP1Q5VSL9 CNRIP1-202ENST00000409559 644 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
STRIP1Q5VSL9 ACTG2-204ENST00000409918 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
STRIP1Q5VSL9 CELP-201ENST00000411440 1249 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
STRIP1Q5VSL9 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
STRIP1Q5VSL9 AL592301.1-201ENST00000439501 864 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
STRIP1Q5VSL9 MIR503HG-202ENST00000440570 760 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
STRIP1Q5VSL9 Metazoa_SRP.100-201ENST00000447610 282 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
STRIP1Q5VSL9 AC011247.2-201ENST00000457097 233 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
STRIP1Q5VSL9 DMKN-229ENST00000467637 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
STRIP1Q5VSL9 AC112487.1-201ENST00000498032 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
STRIP1Q5VSL9 LINC02021-201ENST00000504808 1608 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
STRIP1Q5VSL9 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
STRIP1Q5VSL9 AC138761.4-201ENST00000578881 1514 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
STRIP1Q5VSL9 RN7SL357P-201ENST00000581065 298 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
STRIP1Q5VSL9 AC020934.2-201ENST00000592400 456 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
STRIP1Q5VSL9 AC114296.1-204ENST00000637197 1173 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
STRIP1Q5VSL9 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
STRIP1Q5VSL9 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
STRIP1Q5VSL9 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
STRIP1Q5VSL9 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
STRIP1Q5VSL9 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
STRIP1Q5VSL9 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
STRIP1Q5VSL9 PRPF18-202ENST00000378572 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
STRIP1Q5VSL9 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
STRIP1Q5VSL9 LAIR1-209ENST00000434277 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
STRIP1Q5VSL9 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
STRIP1Q5VSL9 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
STRIP1Q5VSL9 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
STRIP1Q5VSL9 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
STRIP1Q5VSL9 ZNF576-202ENST00000391965 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
STRIP1Q5VSL9 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
STRIP1Q5VSL9 YIPF3-213ENST00000506469 1444 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
STRIP1Q5VSL9 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
STRIP1Q5VSL9 MINDY4B-201ENST00000465419 1383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
STRIP1Q5VSL9 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
STRIP1Q5VSL9 IL17B-201ENST00000261796 696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
STRIP1Q5VSL9 IGHV4-39-201ENST00000390619 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
STRIP1Q5VSL9 KRTAP2-2-201ENST00000398477 733 ntAPPRIS P2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
STRIP1Q5VSL9 LIF-202ENST00000403987 592 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
STRIP1Q5VSL9 MIR1227-201ENST00000408484 88 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
STRIP1Q5VSL9 SOX2-OT-208ENST00000477928 902 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
STRIP1Q5VSL9 AREG-202ENST00000502307 956 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
STRIP1Q5VSL9 ORAOV1-209ENST00000538554 1000 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
STRIP1Q5VSL9 IGHV3OR16-12-201ENST00000570121 353 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
STRIP1Q5VSL9 TMEM220-AS1-207ENST00000584714 541 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
STRIP1Q5VSL9 LINC02081-203ENST00000591384 867 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
STRIP1Q5VSL9 PGPEP1-203ENST00000595066 762 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
STRIP1Q5VSL9 ANXA8L1-206ENST00000619162 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
STRIP1Q5VSL9 FO393412.1-201ENST00000619841 382 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
STRIP1Q5VSL9 SLC12A5-219ENST00000628272 401 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
STRIP1Q5VSL9 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
STRIP1Q5VSL9 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
STRIP1Q5VSL9 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
STRIP1Q5VSL9 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
STRIP1Q5VSL9 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
STRIP1Q5VSL9 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
STRIP1Q5VSL9 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
STRIP1Q5VSL9 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
STRIP1Q5VSL9 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
STRIP1Q5VSL9 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
STRIP1Q5VSL9 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
STRIP1Q5VSL9 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
STRIP1Q5VSL9 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
STRIP1Q5VSL9 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
STRIP1Q5VSL9 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
STRIP1Q5VSL9 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
STRIP1Q5VSL9 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
STRIP1Q5VSL9 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
STRIP1Q5VSL9 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
STRIP1Q5VSL9 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
STRIP1Q5VSL9 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
STRIP1Q5VSL9 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
STRIP1Q5VSL9 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
STRIP1Q5VSL9 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
STRIP1Q5VSL9 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
STRIP1Q5VSL9 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
STRIP1Q5VSL9 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
STRIP1Q5VSL9 TNFRSF1A-202ENST00000366159 1339 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
STRIP1Q5VSL9 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
STRIP1Q5VSL9 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
STRIP1Q5VSL9 ASNA1-201ENST00000357332 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms