Protein–RNA interactions for Protein: Q502W7

CCDC38, Coiled-coil domain-containing protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC38Q502W7 MFSD2B-201ENST00000338315 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC38Q502W7 CHFR-205ENST00000450056 3250 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC38Q502W7 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC38Q502W7 AC022028.2-201ENST00000474115 2619 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC38Q502W7 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC38Q502W7 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC38Q502W7 DAZL-201ENST00000250863 3104 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC38Q502W7 CDK20-202ENST00000336654 2176 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC38Q502W7 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC38Q502W7 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC38Q502W7 PDZD7-206ENST00000619208 4135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC38Q502W7 AC130686.1-201ENST00000622936 2466 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC38Q502W7 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC38Q502W7 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC38Q502W7 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC38Q502W7 FAM156A-221ENST00000622447 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC38Q502W7 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC38Q502W7 TRIM10-204ENST00000449742 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC38Q502W7 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC38Q502W7 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC38Q502W7 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC38Q502W7 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC38Q502W7 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC38Q502W7 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC38Q502W7 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC38Q502W7 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC38Q502W7 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC38Q502W7 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC38Q502W7 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC38Q502W7 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC38Q502W7 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC38Q502W7 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC38Q502W7 AC036214.1-201ENST00000502766 2126 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC38Q502W7 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC38Q502W7 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC38Q502W7 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC38Q502W7 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC38Q502W7 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC38Q502W7 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC38Q502W7 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC38Q502W7 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC38Q502W7 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC38Q502W7 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC38Q502W7 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC38Q502W7 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC38Q502W7 STAB1-201ENST00000321725 7928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC38Q502W7 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC38Q502W7 SLC6A6P1-201ENST00000413933 1850 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC38Q502W7 XG-201ENST00000381174 2315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC38Q502W7 FGR-204ENST00000399173 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC38Q502W7 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC38Q502W7 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC38Q502W7 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC38Q502W7 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC38Q502W7 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC38Q502W7 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC38Q502W7 ANO9-201ENST00000332826 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC38Q502W7 LINC00863-201ENST00000439559 3287 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC38Q502W7 POLG-201ENST00000268124 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC38Q502W7 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC38Q502W7 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC38Q502W7 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC38Q502W7 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC38Q502W7 GDPD5-201ENST00000336898 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC38Q502W7 PAG1-201ENST00000220597 10744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC38Q502W7 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC38Q502W7 MFSD11-217ENST00000590514 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC38Q502W7 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC38Q502W7 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC38Q502W7 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC38Q502W7 MAPRE2-201ENST00000300249 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC38Q502W7 AC027612.1-201ENST00000445234 2395 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC38Q502W7 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC38Q502W7 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC38Q502W7 ITGB3-201ENST00000559488 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC38Q502W7 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC38Q502W7 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC38Q502W7 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC38Q502W7 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC38Q502W7 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC38Q502W7 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC38Q502W7 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC38Q502W7 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC38Q502W7 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC38Q502W7 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC38Q502W7 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC38Q502W7 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC38Q502W7 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC38Q502W7 PCDHB3-201ENST00000231130 3355 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC38Q502W7 SUV39H2-201ENST00000313519 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC38Q502W7 SLC23A1-201ENST00000348729 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC38Q502W7 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC38Q502W7 CFAP74-209ENST00000493964 5247 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC38Q502W7 DDX31-204ENST00000372159 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC38Q502W7 KIRREL1-204ENST00000368173 7519 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC38Q502W7 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC38Q502W7 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC38Q502W7 ESPN-201ENST00000377828 3531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC38Q502W7 PRF1-202ENST00000441259 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC38Q502W7 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms