Protein–RNA interactions for Protein: Q17RW2

COL24A1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,714 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL24A1Q17RW2 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
COL24A1Q17RW2 AL050341.2-201ENST00000567508 1541 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
COL24A1Q17RW2 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
COL24A1Q17RW2 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
COL24A1Q17RW2 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
COL24A1Q17RW2 UBL7-206ENST00000565335 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
COL24A1Q17RW2 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
COL24A1Q17RW2 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
COL24A1Q17RW2 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
COL24A1Q17RW2 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
COL24A1Q17RW2 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
COL24A1Q17RW2 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
COL24A1Q17RW2 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
COL24A1Q17RW2 GOT2-202ENST00000434819 1615 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
COL24A1Q17RW2 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
COL24A1Q17RW2 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
COL24A1Q17RW2 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
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COL24A1Q17RW2 AL592301.1-201ENST00000439501 864 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
COL24A1Q17RW2 AC253536.3-201ENST00000444093 558 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
COL24A1Q17RW2 TREX1-203ENST00000456089 629 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
COL24A1Q17RW2 AC005740.1-201ENST00000515639 522 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
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COL24A1Q17RW2 AP003040.1-201ENST00000532044 1024 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
COL24A1Q17RW2 C12orf73-210ENST00000552940 685 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
COL24A1Q17RW2 AP001043.1-206ENST00000613045 730 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
COL24A1Q17RW2 AP003900.1-201ENST00000622592 859 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
COL24A1Q17RW2 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
COL24A1Q17RW2 HPGD-209ENST00000510901 1535 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
COL24A1Q17RW2 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
COL24A1Q17RW2 FAM226B-201ENST00000602508 1490 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
COL24A1Q17RW2 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
COL24A1Q17RW2 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
COL24A1Q17RW2 FAM76A-203ENST00000373949 2273 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
COL24A1Q17RW2 IFITM1-201ENST00000328221 844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
COL24A1Q17RW2 IFITM1-202ENST00000408968 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
COL24A1Q17RW2 AP001628.2-201ENST00000420273 784 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
COL24A1Q17RW2 CBR3-AS1-202ENST00000427491 741 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
COL24A1Q17RW2 AL353658.1-201ENST00000436263 789 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
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COL24A1Q17RW2 AC008747.1-201ENST00000592220 442 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
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COL24A1Q17RW2 RNF103-CHMP3-202ENST00000604011 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
COL24A1Q17RW2 CBR3-AS1-207ENST00000608641 777 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
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COL24A1Q17RW2 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
COL24A1Q17RW2 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
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COL24A1Q17RW2 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
COL24A1Q17RW2 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
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COL24A1Q17RW2 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
COL24A1Q17RW2 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
COL24A1Q17RW2 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
COL24A1Q17RW2 SLC25A31-201ENST00000281154 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
COL24A1Q17RW2 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
COL24A1Q17RW2 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
COL24A1Q17RW2 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
COL24A1Q17RW2 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
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COL24A1Q17RW2 HPGD-201ENST00000296521 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
COL24A1Q17RW2 MORN2-201ENST00000340556 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
COL24A1Q17RW2 TCEA3-201ENST00000374601 1197 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
COL24A1Q17RW2 CD79B-203ENST00000392795 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
COL24A1Q17RW2 AC006987.1-201ENST00000413610 527 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
COL24A1Q17RW2 IGHV3-43-201ENST00000434710 434 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
COL24A1Q17RW2 AL137026.2-201ENST00000437014 841 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
COL24A1Q17RW2 NALT1-202ENST00000450304 437 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
COL24A1Q17RW2 PRSS3P1-201ENST00000503996 742 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
COL24A1Q17RW2 SKA2-205ENST00000580541 689 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
COL24A1Q17RW2 AL359091.4-201ENST00000610052 409 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
COL24A1Q17RW2 AC020922.4-201ENST00000621389 339 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
COL24A1Q17RW2 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
COL24A1Q17RW2 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
COL24A1Q17RW2 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
COL24A1Q17RW2 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
COL24A1Q17RW2 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
COL24A1Q17RW2 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
COL24A1Q17RW2 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
COL24A1Q17RW2 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
COL24A1Q17RW2 TACC3-212ENST00000612220 1756 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
COL24A1Q17RW2 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
COL24A1Q17RW2 MSRA-201ENST00000317173 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
COL24A1Q17RW2 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
COL24A1Q17RW2 PDXDC2P-206ENST00000534700 1315 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
COL24A1Q17RW2 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
COL24A1Q17RW2 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
COL24A1Q17RW2 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
COL24A1Q17RW2 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
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