Protein–RNA interactions for Protein: Q16836

HADH, Hydroxyacyl-coenzyme A dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HADHQ16836 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HADHQ16836 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
HADHQ16836 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HADHQ16836 PNPLA6-201ENST00000221249 4617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HADHQ16836 DHTKD1-201ENST00000263035 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HADHQ16836 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HADHQ16836 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HADHQ16836 B3GAT1-203ENST00000524765 5737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HADHQ16836 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HADHQ16836 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HADHQ16836 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HADHQ16836 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HADHQ16836 NEDD4L-238ENST00000635997 4402 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HADHQ16836 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HADHQ16836 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HADHQ16836 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HADHQ16836 USP3-204ENST00000540797 5474 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HADHQ16836 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HADHQ16836 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HADHQ16836 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HADHQ16836 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HADHQ16836 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HADHQ16836 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HADHQ16836 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HADHQ16836 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HADHQ16836 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
HADHQ16836 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HADHQ16836 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
HADHQ16836 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HADHQ16836 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HADHQ16836 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HADHQ16836 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HADHQ16836 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HADHQ16836 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
HADHQ16836 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HADHQ16836 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HADHQ16836 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HADHQ16836 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HADHQ16836 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HADHQ16836 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HADHQ16836 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
HADHQ16836 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HADHQ16836 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HADHQ16836 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HADHQ16836 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HADHQ16836 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HADHQ16836 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HADHQ16836 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HADHQ16836 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
HADHQ16836 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HADHQ16836 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HADHQ16836 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HADHQ16836 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HADHQ16836 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HADHQ16836 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
HADHQ16836 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
HADHQ16836 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
HADHQ16836 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
HADHQ16836 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
HADHQ16836 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
HADHQ16836 ABCA7-202ENST00000433129 6704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
HADHQ16836 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
HADHQ16836 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
HADHQ16836 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HADHQ16836 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HADHQ16836 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HADHQ16836 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HADHQ16836 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HADHQ16836 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HADHQ16836 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HADHQ16836 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HADHQ16836 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HADHQ16836 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
HADHQ16836 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HADHQ16836 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HADHQ16836 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HADHQ16836 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HADHQ16836 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
HADHQ16836 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HADHQ16836 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HADHQ16836 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HADHQ16836 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HADHQ16836 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HADHQ16836 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HADHQ16836 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HADHQ16836 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HADHQ16836 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HADHQ16836 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
HADHQ16836 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
HADHQ16836 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HADHQ16836 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HADHQ16836 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HADHQ16836 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HADHQ16836 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
HADHQ16836 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HADHQ16836 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HADHQ16836 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HADHQ16836 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HADHQ16836 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
HADHQ16836 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms