Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
ZNF239Q16600 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ZNF239Q16600 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
ZNF239Q16600 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
ZNF239Q16600 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
ZNF239Q16600 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ZNF239Q16600 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ZNF239Q16600 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
ZNF239Q16600 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ZNF239Q16600 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ZNF239Q16600 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
ZNF239Q16600 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
ZNF239Q16600 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ZNF239Q16600 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
ZNF239Q16600 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ZNF239Q16600 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ZNF239Q16600 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
ZNF239Q16600 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ZNF239Q16600 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
ZNF239Q16600 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ZNF239Q16600 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
ZNF239Q16600 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ZNF239Q16600 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ZNF239Q16600 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ZNF239Q16600 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ZNF239Q16600 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ZNF239Q16600 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ZNF239Q16600 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ZNF239Q16600 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ZNF239Q16600 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ZNF239Q16600 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
ZNF239Q16600 AC126335.2-201ENST00000623362 4637 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
ZNF239Q16600 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ZNF239Q16600 OTOF-202ENST00000338581 4954 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ZNF239Q16600 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ZNF239Q16600 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ZNF239Q16600 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ZNF239Q16600 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ZNF239Q16600 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ZNF239Q16600 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ZNF239Q16600 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ZNF239Q16600 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ZNF239Q16600 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ZNF239Q16600 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
ZNF239Q16600 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ZNF239Q16600 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ZNF239Q16600 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
ZNF239Q16600 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ZNF239Q16600 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ZNF239Q16600 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ZNF239Q16600 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
ZNF239Q16600 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
ZNF239Q16600 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ZNF239Q16600 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ZNF239Q16600 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ZNF239Q16600 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ZNF239Q16600 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ZNF239Q16600 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ZNF239Q16600 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ZNF239Q16600 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ZNF239Q16600 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ZNF239Q16600 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ZNF239Q16600 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ZNF239Q16600 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ZNF239Q16600 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ZNF239Q16600 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ZNF239Q16600 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ZNF239Q16600 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ZNF239Q16600 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ZNF239Q16600 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ZNF239Q16600 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ZNF239Q16600 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ZNF239Q16600 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ZNF239Q16600 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ZNF239Q16600 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ZNF239Q16600 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ZNF239Q16600 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
ZNF239Q16600 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ZNF239Q16600 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ZNF239Q16600 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
ZNF239Q16600 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ZNF239Q16600 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ZNF239Q16600 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ZNF239Q16600 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ZNF239Q16600 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ZNF239Q16600 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ZNF239Q16600 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ZNF239Q16600 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ZNF239Q16600 FHDC1-202ENST00000511601 6583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ZNF239Q16600 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ZNF239Q16600 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ZNF239Q16600 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ZNF239Q16600 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ZNF239Q16600 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ZNF239Q16600 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ZNF239Q16600 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ZNF239Q16600 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ZNF239Q16600 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ZNF239Q16600 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ZNF239Q16600 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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