Protein–RNA interactions for Protein: Q15788

NCOA1, Nuclear receptor coactivator 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA1Q15788 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NCOA1Q15788 RELL1-201ENST00000314117 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NCOA1Q15788 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NCOA1Q15788 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NCOA1Q15788 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NCOA1Q15788 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NCOA1Q15788 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
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NCOA1Q15788 MRPL32-201ENST00000223324 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NCOA1Q15788 AC004522.1-201ENST00000419978 654 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
NCOA1Q15788 SPINT2-204ENST00000587090 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
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NCOA1Q15788 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
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NCOA1Q15788 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NCOA1Q15788 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NCOA1Q15788 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NCOA1Q15788 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
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NCOA1Q15788 OR3A2-205ENST00000641164 2033 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NCOA1Q15788 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
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NCOA1Q15788 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NCOA1Q15788 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NCOA1Q15788 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NCOA1Q15788 METAP2-205ENST00000546753 1862 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NCOA1Q15788 CD59-201ENST00000351554 1775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NCOA1Q15788 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NCOA1Q15788 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
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NCOA1Q15788 AC244197.1-201ENST00000456494 951 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
NCOA1Q15788 MT3-203ENST00000565838 421 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
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NCOA1Q15788 AC103808.3-201ENST00000579714 598 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
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NCOA1Q15788 OPRM1-207ENST00000428397 1481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
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NCOA1Q15788 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
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NCOA1Q15788 NOP16-211ENST00000621444 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NCOA1Q15788 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
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NCOA1Q15788 LINC01815-202ENST00000641468 1409 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
NCOA1Q15788 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NCOA1Q15788 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NCOA1Q15788 SARS2-202ENST00000430193 1886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
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NCOA1Q15788 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
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NCOA1Q15788 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NCOA1Q15788 ZNF436-AS1-201ENST00000335648 2547 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
NCOA1Q15788 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NCOA1Q15788 POLR3K-201ENST00000293860 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NCOA1Q15788 ACP2-212ENST00000533929 1366 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NCOA1Q15788 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NCOA1Q15788 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NCOA1Q15788 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NCOA1Q15788 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NCOA1Q15788 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NCOA1Q15788 COX14-201ENST00000317943 708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
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