Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SIX1Q15475 CNGA3-204ENST00000409937 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SIX1Q15475 GNAS-215ENST00000371102 3438 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SIX1Q15475 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SIX1Q15475 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SIX1Q15475 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SIX1Q15475 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SIX1Q15475 AC027612.1-201ENST00000445234 2395 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SIX1Q15475 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SIX1Q15475 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SIX1Q15475 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SIX1Q15475 NAP1L2-201ENST00000373517 2550 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SIX1Q15475 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SIX1Q15475 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SIX1Q15475 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SIX1Q15475 BORCS8-202ENST00000462790 1429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SIX1Q15475 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SIX1Q15475 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SIX1Q15475 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SIX1Q15475 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SIX1Q15475 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SIX1Q15475 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SIX1Q15475 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SIX1Q15475 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SIX1Q15475 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SIX1Q15475 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SIX1Q15475 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SIX1Q15475 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SIX1Q15475 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SIX1Q15475 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SIX1Q15475 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SIX1Q15475 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SIX1Q15475 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SIX1Q15475 BAP1-211ENST00000615113 489 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SIX1Q15475 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SIX1Q15475 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SIX1Q15475 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SIX1Q15475 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SIX1Q15475 CNTN1-203ENST00000547702 3033 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SIX1Q15475 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SIX1Q15475 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SIX1Q15475 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SIX1Q15475 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SIX1Q15475 AGAP5-201ENST00000374094 2394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SIX1Q15475 MEAF6-203ENST00000373074 2005 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SIX1Q15475 PP14571-202ENST00000404891 2017 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SIX1Q15475 DDC-207ENST00000444124 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SIX1Q15475 AL512306.2-201ENST00000444037 2219 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SIX1Q15475 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SIX1Q15475 LINC02135-201ENST00000599486 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SIX1Q15475 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SIX1Q15475 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SIX1Q15475 PLEKHB2-205ENST00000409279 2488 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SIX1Q15475 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SIX1Q15475 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SIX1Q15475 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SIX1Q15475 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SIX1Q15475 AL139193.2-201ENST00000553712 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SIX1Q15475 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SIX1Q15475 MOG-221ENST00000376917 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SIX1Q15475 KIFC3-202ENST00000421376 3128 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SIX1Q15475 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SIX1Q15475 MCRIP1-207ENST00000574190 2775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SIX1Q15475 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SIX1Q15475 USP48-213ENST00000529637 3228 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SIX1Q15475 SETD6-203ENST00000394266 3423 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SIX1Q15475 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SIX1Q15475 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SIX1Q15475 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SIX1Q15475 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SIX1Q15475 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SIX1Q15475 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SIX1Q15475 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SIX1Q15475 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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SIX1Q15475 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SIX1Q15475 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
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SIX1Q15475 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
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SIX1Q15475 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SIX1Q15475 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SIX1Q15475 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SIX1Q15475 PPP5D1-201ENST00000414155 1882 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SIX1Q15475 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SIX1Q15475 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SIX1Q15475 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SIX1Q15475 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SIX1Q15475 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SIX1Q15475 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SIX1Q15475 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SIX1Q15475 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SIX1Q15475 OSBPL2-201ENST00000313733 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SIX1Q15475 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SIX1Q15475 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SIX1Q15475 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SIX1Q15475 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SIX1Q15475 CPT1B-202ENST00000360719 2319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SIX1Q15475 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SIX1Q15475 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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