Protein–RNA interactions for Protein: Q15035

TRAM2, Translocating chain-associated membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2Q15035 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
TRAM2Q15035 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRAM2Q15035 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
TRAM2Q15035 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRAM2Q15035 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
TRAM2Q15035 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRAM2Q15035 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRAM2Q15035 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
TRAM2Q15035 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRAM2Q15035 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
TRAM2Q15035 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRAM2Q15035 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRAM2Q15035 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRAM2Q15035 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRAM2Q15035 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRAM2Q15035 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
TRAM2Q15035 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRAM2Q15035 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRAM2Q15035 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRAM2Q15035 PCM1-201ENST00000325083 6820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRAM2Q15035 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRAM2Q15035 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRAM2Q15035 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRAM2Q15035 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRAM2Q15035 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRAM2Q15035 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRAM2Q15035 ST6GAL1-201ENST00000169298 4645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRAM2Q15035 ADCY6-201ENST00000307885 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRAM2Q15035 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRAM2Q15035 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRAM2Q15035 ACAN-202ENST00000439576 8840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRAM2Q15035 ITGB2-208ENST00000397857 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRAM2Q15035 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRAM2Q15035 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRAM2Q15035 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRAM2Q15035 PARVB-201ENST00000338758 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRAM2Q15035 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRAM2Q15035 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRAM2Q15035 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRAM2Q15035 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRAM2Q15035 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRAM2Q15035 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRAM2Q15035 AC131212.3-201ENST00000624087 4219 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
TRAM2Q15035 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRAM2Q15035 PRDM16-206ENST00000511072 4282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRAM2Q15035 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRAM2Q15035 NRP2-201ENST00000272849 5909 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRAM2Q15035 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRAM2Q15035 GRIN1-203ENST00000371550 3940 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRAM2Q15035 SEPT7-202ENST00000399034 4399 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRAM2Q15035 CCSER2-203ENST00000372088 7657 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRAM2Q15035 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRAM2Q15035 UMODL1-204ENST00000400427 5442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRAM2Q15035 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRAM2Q15035 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRAM2Q15035 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRAM2Q15035 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRAM2Q15035 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRAM2Q15035 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRAM2Q15035 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRAM2Q15035 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
TRAM2Q15035 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
TRAM2Q15035 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRAM2Q15035 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRAM2Q15035 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRAM2Q15035 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRAM2Q15035 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRAM2Q15035 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRAM2Q15035 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRAM2Q15035 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRAM2Q15035 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
TRAM2Q15035 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRAM2Q15035 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
TRAM2Q15035 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
TRAM2Q15035 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
TRAM2Q15035 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRAM2Q15035 SAMD4B-201ENST00000314471 4519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRAM2Q15035 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRAM2Q15035 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRAM2Q15035 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRAM2Q15035 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRAM2Q15035 SLC25A29-208ENST00000554912 5169 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRAM2Q15035 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRAM2Q15035 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRAM2Q15035 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRAM2Q15035 MAPRE2-201ENST00000300249 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRAM2Q15035 ARHGAP45-201ENST00000313093 4273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRAM2Q15035 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRAM2Q15035 FBXO21-202ENST00000427718 4138 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRAM2Q15035 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRAM2Q15035 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
TRAM2Q15035 SMG9-211ENST00000601170 2387 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRAM2Q15035 AC015802.6-201ENST00000640006 5654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRAM2Q15035 TMEM132C-201ENST00000435159 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRAM2Q15035 NEDD4L-238ENST00000635997 4402 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRAM2Q15035 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRAM2Q15035 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRAM2Q15035 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRAM2Q15035 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRAM2Q15035 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms