Protein–RNA interactions for Protein: Q14993

COL19A1, Collagen alpha-1(XIX) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL19A1Q14993 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
COL19A1Q14993 RHOG-201ENST00000351018 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
COL19A1Q14993 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
COL19A1Q14993 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
COL19A1Q14993 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
COL19A1Q14993 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
COL19A1Q14993 SLC9A3P3-201ENST00000457608 2229 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
COL19A1Q14993 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
COL19A1Q14993 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
COL19A1Q14993 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
COL19A1Q14993 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
COL19A1Q14993 PGAM2-201ENST00000297283 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
COL19A1Q14993 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
COL19A1Q14993 HIST1H2BF-201ENST00000356530 1196 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
COL19A1Q14993 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
COL19A1Q14993 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
COL19A1Q14993 AP000354.1-201ENST00000396982 456 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
COL19A1Q14993 WASIR1-201ENST00000399966 1054 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
COL19A1Q14993 AL391839.2-201ENST00000412085 383 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
COL19A1Q14993 BX679664.3-201ENST00000414070 555 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
COL19A1Q14993 KRT18P4-201ENST00000422599 1288 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
COL19A1Q14993 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
COL19A1Q14993 AC093609.1-201ENST00000434020 952 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
COL19A1Q14993 TMEM14B-208ENST00000467317 1224 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
COL19A1Q14993 AC113935.1-201ENST00000471722 555 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
COL19A1Q14993 AADACL2-AS1-202ENST00000483843 628 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
COL19A1Q14993 RN7SL375P-201ENST00000492442 298 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
COL19A1Q14993 AC138409.2-203ENST00000508395 553 ntTSL 4 BASIC14.96□□□□□ -0.01
COL19A1Q14993 AC010255.3-203ENST00000509403 1727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
COL19A1Q14993 AC010285.2-201ENST00000510240 569 ntTSL 4 BASIC14.96□□□□□ -0.01
COL19A1Q14993 AC087620.1-201ENST00000520037 447 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
COL19A1Q14993 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
COL19A1Q14993 AP000866.5-201ENST00000531241 445 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
COL19A1Q14993 C12orf73-210ENST00000552940 685 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
COL19A1Q14993 AC023968.2-201ENST00000560593 1049 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
COL19A1Q14993 AC145285.5-201ENST00000562217 361 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
COL19A1Q14993 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
COL19A1Q14993 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
COL19A1Q14993 POLR2E-204ENST00000586746 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
COL19A1Q14993 AC017033.1-201ENST00000603720 708 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
COL19A1Q14993 AC004686.1-201ENST00000605113 538 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
COL19A1Q14993 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
COL19A1Q14993 AL009176.1-201ENST00000607876 650 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
COL19A1Q14993 AC073578.2-201ENST00000618927 464 ntTSL 4 BASIC14.96□□□□□ -0.01
COL19A1Q14993 OSMR-AS1-204ENST00000636516 850 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
COL19A1Q14993 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
COL19A1Q14993 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
COL19A1Q14993 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
COL19A1Q14993 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
COL19A1Q14993 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
COL19A1Q14993 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
COL19A1Q14993 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
COL19A1Q14993 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
COL19A1Q14993 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
COL19A1Q14993 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
COL19A1Q14993 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC14.96□□□□□ -0.02
COL19A1Q14993 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
COL19A1Q14993 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.96□□□□□ -0.02
COL19A1Q14993 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
COL19A1Q14993 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
COL19A1Q14993 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
COL19A1Q14993 ATP5A1-201ENST00000282050 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
COL19A1Q14993 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
COL19A1Q14993 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
COL19A1Q14993 ODCP-201ENST00000459650 1639 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
COL19A1Q14993 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
COL19A1Q14993 LAP3P2-201ENST00000454686 1454 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
COL19A1Q14993 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
COL19A1Q14993 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
COL19A1Q14993 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
COL19A1Q14993 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
COL19A1Q14993 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
COL19A1Q14993 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
COL19A1Q14993 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
COL19A1Q14993 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
COL19A1Q14993 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
COL19A1Q14993 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
COL19A1Q14993 LINC002481-201ENST00000499502 1821 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
COL19A1Q14993 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
COL19A1Q14993 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
COL19A1Q14993 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
COL19A1Q14993 GEMIN8P4-201ENST00000380526 729 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
COL19A1Q14993 CST1-202ENST00000398402 655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
COL19A1Q14993 COPS7B-204ENST00000409091 806 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
COL19A1Q14993 OR52M2P-201ENST00000414298 959 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
COL19A1Q14993 ATXN8OS-202ENST00000424524 1236 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
COL19A1Q14993 AC025186.1-201ENST00000478174 870 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
COL19A1Q14993 AC092612.1-201ENST00000514501 998 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
COL19A1Q14993 AC111149.2-202ENST00000518355 599 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
COL19A1Q14993 CRADD-205ENST00000548483 1056 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
COL19A1Q14993 HNRNPA1P5-201ENST00000558213 966 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
COL19A1Q14993 CES1P2-201ENST00000566467 1242 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
COL19A1Q14993 COQ4-204ENST00000608951 781 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
COL19A1Q14993 AL021707.6-201ENST00000609212 491 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
COL19A1Q14993 AC011462.4-201ENST00000616866 449 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
COL19A1Q14993 AC129778.1-201ENST00000623957 920 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
COL19A1Q14993 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
COL19A1Q14993 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
COL19A1Q14993 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
COL19A1Q14993 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.8 ms