Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMC1AQ14683 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMC1AQ14683 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMC1AQ14683 DSN1-203ENST00000373750 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMC1AQ14683 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMC1AQ14683 RNF183-206ENST00000478815 2312 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMC1AQ14683 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMC1AQ14683 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMC1AQ14683 INF2-209ENST00000617571 2956 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMC1AQ14683 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMC1AQ14683 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMC1AQ14683 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMC1AQ14683 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMC1AQ14683 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMC1AQ14683 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMC1AQ14683 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMC1AQ14683 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMC1AQ14683 AKAP12-204ENST00000402676 8432 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMC1AQ14683 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMC1AQ14683 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMC1AQ14683 A1CF-202ENST00000373993 1997 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMC1AQ14683 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMC1AQ14683 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SMC1AQ14683 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMC1AQ14683 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMC1AQ14683 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMC1AQ14683 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMC1AQ14683 TMEM189-202ENST00000371652 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMC1AQ14683 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMC1AQ14683 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMC1AQ14683 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMC1AQ14683 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMC1AQ14683 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SMC1AQ14683 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMC1AQ14683 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SMC1AQ14683 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMC1AQ14683 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMC1AQ14683 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMC1AQ14683 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMC1AQ14683 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMC1AQ14683 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMC1AQ14683 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SMC1AQ14683 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMC1AQ14683 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMC1AQ14683 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMC1AQ14683 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMC1AQ14683 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMC1AQ14683 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMC1AQ14683 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SMC1AQ14683 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMC1AQ14683 ACAN-202ENST00000439576 8840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMC1AQ14683 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMC1AQ14683 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMC1AQ14683 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMC1AQ14683 SLFNL1-204ENST00000372613 2654 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMC1AQ14683 DMTN-214ENST00000519907 2658 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMC1AQ14683 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMC1AQ14683 ROCK1-201ENST00000399799 9484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMC1AQ14683 DEPTOR-201ENST00000286234 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMC1AQ14683 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMC1AQ14683 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMC1AQ14683 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMC1AQ14683 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMC1AQ14683 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMC1AQ14683 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMC1AQ14683 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SMC1AQ14683 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMC1AQ14683 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMC1AQ14683 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMC1AQ14683 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMC1AQ14683 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMC1AQ14683 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMC1AQ14683 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMC1AQ14683 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMC1AQ14683 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMC1AQ14683 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMC1AQ14683 DENND1B-211ENST00000620048 8378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMC1AQ14683 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMC1AQ14683 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMC1AQ14683 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMC1AQ14683 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SMC1AQ14683 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SMC1AQ14683 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMC1AQ14683 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMC1AQ14683 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMC1AQ14683 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMC1AQ14683 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SMC1AQ14683 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SMC1AQ14683 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SMC1AQ14683 AC099521.3-201ENST00000624251 2938 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SMC1AQ14683 SOAT1-203ENST00000539888 6794 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMC1AQ14683 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMC1AQ14683 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMC1AQ14683 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMC1AQ14683 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMC1AQ14683 AC126335.2-201ENST00000623362 4637 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SMC1AQ14683 GALNT3-201ENST00000392701 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMC1AQ14683 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMC1AQ14683 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMC1AQ14683 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.1 ms