Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
APOFQ13790 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
APOFQ13790 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
APOFQ13790 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
APOFQ13790 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
APOFQ13790 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
APOFQ13790 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
APOFQ13790 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
APOFQ13790 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
APOFQ13790 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
APOFQ13790 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
APOFQ13790 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
APOFQ13790 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
APOFQ13790 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
APOFQ13790 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
APOFQ13790 YWHAQ-201ENST00000238081 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
APOFQ13790 SLC9A3P3-201ENST00000457608 2229 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
APOFQ13790 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
APOFQ13790 RRM2B-211ENST00000621845 3483 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
APOFQ13790 KCNMA1-287ENST00000640632 2808 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
APOFQ13790 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
APOFQ13790 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
APOFQ13790 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
APOFQ13790 TRIM4-203ENST00000355947 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
APOFQ13790 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
APOFQ13790 Z98257.2-202ENST00000641138 1548 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
APOFQ13790 ZNF829-201ENST00000391711 1805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
APOFQ13790 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
APOFQ13790 SLC12A6-206ENST00000558589 3866 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
APOFQ13790 NGLY1-205ENST00000417874 2062 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
APOFQ13790 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
APOFQ13790 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
APOFQ13790 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
APOFQ13790 PRRT3-203ENST00000412055 3761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
APOFQ13790 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
APOFQ13790 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
APOFQ13790 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
APOFQ13790 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
APOFQ13790 CHMP7-201ENST00000313219 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
APOFQ13790 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
APOFQ13790 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
APOFQ13790 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
APOFQ13790 AP001062.1-201ENST00000448927 4354 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
APOFQ13790 TDRD5-201ENST00000294848 3525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
APOFQ13790 KRT33B-201ENST00000251646 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
APOFQ13790 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
APOFQ13790 EBF3-201ENST00000355311 2993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
APOFQ13790 MAPK14-202ENST00000229795 4319 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
APOFQ13790 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
APOFQ13790 B4GALT3-202ENST00000367998 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
APOFQ13790 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
APOFQ13790 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
APOFQ13790 Z97192.2-201ENST00000393264 2379 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
APOFQ13790 AGAP12P-201ENST00000585227 2359 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
APOFQ13790 ROPN1B-202ENST00000504401 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
APOFQ13790 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
APOFQ13790 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
APOFQ13790 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
APOFQ13790 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
APOFQ13790 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
APOFQ13790 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
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APOFQ13790 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
APOFQ13790 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
APOFQ13790 AC016730.1-201ENST00000420828 832 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
APOFQ13790 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
APOFQ13790 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
APOFQ13790 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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APOFQ13790 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
APOFQ13790 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
APOFQ13790 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC13.72□□□□□ -0.21
APOFQ13790 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
APOFQ13790 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
APOFQ13790 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
APOFQ13790 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
APOFQ13790 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
APOFQ13790 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
APOFQ13790 ACTN1-204ENST00000438964 3043 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
APOFQ13790 H3F3B-201ENST00000254810 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
APOFQ13790 TUBGCP6-201ENST00000248846 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
APOFQ13790 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
APOFQ13790 LILRA1-201ENST00000251372 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
APOFQ13790 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
APOFQ13790 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
APOFQ13790 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
APOFQ13790 HPX-201ENST00000265983 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
APOFQ13790 CPT1A-202ENST00000376618 2635 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
APOFQ13790 ABCB7-203ENST00000373394 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
APOFQ13790 BX324167.2-201ENST00000623717 3316 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
APOFQ13790 SIGLEC12-201ENST00000291707 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
APOFQ13790 PDE9A-201ENST00000291539 2058 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
APOFQ13790 FAM86B1-203ENST00000448228 2096 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
APOFQ13790 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
APOFQ13790 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
APOFQ13790 ATG4C-201ENST00000317868 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
APOFQ13790 CNN2-202ENST00000348419 2033 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
APOFQ13790 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
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